Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KRW8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KRW8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KRW8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KRW8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KRW8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KRW8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KRW8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KRW8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KRW8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KRW8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KRW8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KRW8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KRW8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KRW8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KRW8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KRW8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KRW8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KRW8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KRW8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KRW8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KRW8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KRW8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KRW8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KRW8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KRW8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KRW8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KRW8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
J3KRW8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
J3KRW8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
J3KRW8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
J3KRW8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
J3KRW8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
J3KRW8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
J3KRW8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
J3KRW8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
J3KRW8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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