Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.3 ms