Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms