Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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