Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.3 ms