Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2341 ms