Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPRYD3Q8NCJ5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRYD3Q8NCJ5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms