Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP12Q9Y561 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP12Q9Y561 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP12Q9Y561 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP12Q9Y561 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP12Q9Y561 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP12Q9Y561 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP12Q9Y561 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP12Q9Y561 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP12Q9Y561 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP12Q9Y561 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP12Q9Y561 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP12Q9Y561 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP12Q9Y561 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP12Q9Y561 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP12Q9Y561 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP12Q9Y561 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP12Q9Y561 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP12Q9Y561 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP12Q9Y561 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP12Q9Y561 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP12Q9Y561 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP12Q9Y561 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP12Q9Y561 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP12Q9Y561 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP12Q9Y561 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRP12Q9Y561 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRP12Q9Y561 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRP12Q9Y561 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRP12Q9Y561 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRP12Q9Y561 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP12Q9Y561 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP12Q9Y561 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP12Q9Y561 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP12Q9Y561 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP12Q9Y561 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP12Q9Y561 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP12Q9Y561 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP12Q9Y561 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP12Q9Y561 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP12Q9Y561 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP12Q9Y561 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP12Q9Y561 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP12Q9Y561 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP12Q9Y561 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP12Q9Y561 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRP12Q9Y561 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP12Q9Y561 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP12Q9Y561 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP12Q9Y561 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP12Q9Y561 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP12Q9Y561 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP12Q9Y561 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP12Q9Y561 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP12Q9Y561 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP12Q9Y561 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP12Q9Y561 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP12Q9Y561 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP12Q9Y561 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP12Q9Y561 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP12Q9Y561 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP12Q9Y561 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP12Q9Y561 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP12Q9Y561 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP12Q9Y561 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP12Q9Y561 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP12Q9Y561 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP12Q9Y561 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP12Q9Y561 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP12Q9Y561 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP12Q9Y561 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP12Q9Y561 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRP12Q9Y561 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRP12Q9Y561 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRP12Q9Y561 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRP12Q9Y561 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP12Q9Y561 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP12Q9Y561 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP12Q9Y561 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP12Q9Y561 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP12Q9Y561 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP12Q9Y561 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP12Q9Y561 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP12Q9Y561 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP12Q9Y561 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP12Q9Y561 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP12Q9Y561 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP12Q9Y561 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP12Q9Y561 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP12Q9Y561 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP12Q9Y561 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP12Q9Y561 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP12Q9Y561 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP12Q9Y561 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP12Q9Y561 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP12Q9Y561 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP12Q9Y561 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP12Q9Y561 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP12Q9Y561 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP12Q9Y561 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms