Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2R4

DDX52, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX52, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX52Q9Y2R4 RGS20-205ENST00000517659 1518 ntTSL 1 (best)6.39□□□□□ -1.397e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.447e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 RGS20-209ENST00000523280 1434 ntTSL 1 (best)5□□□□□ -1.617e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.914e-10■■■■■ 33.1
DDX52Q9Y2R4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.884e-10■■■■■ 33.1
DDX52Q9Y2R4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.724e-10■■■■■ 33.1
DDX52Q9Y2R4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.664e-10■■■■■ 33.1
DDX52Q9Y2R4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.644e-10■■■■■ 33.1
DDX52Q9Y2R4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.522e-6■■■■■ 33.1
DDX52Q9Y2R4 PPP1R12C-209ENST00000592993 2269 ntTSL 1 (best)24.08■■□□□ 1.442e-6■■■■■ 33.1
DDX52Q9Y2R4 ZDHHC8-204ENST00000436518 557 ntTSL 418.89■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 33.1
DDX52Q9Y2R4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 33.1
DDX52Q9Y2R4 ZDHHC8-205ENST00000468112 524 ntTSL 316.89■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 33.1
DDX52Q9Y2R4 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 33.1
DDX52Q9Y2R4 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 33.1
DDX52Q9Y2R4 AC132217.1-201ENST00000430034 373 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.763e-9■■■■■ 33
DDX52Q9Y2R4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.845e-6■■■■■ 32.8
DDX52Q9Y2R4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.695e-6■■■■■ 32.8
DDX52Q9Y2R4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.265e-6■■■■■ 32.8
DDX52Q9Y2R4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.45e-6■■■■■ 32.8
DDX52Q9Y2R4 AKT1-208ENST00000554581 3916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.275e-6■■■■■ 32.8
DDX52Q9Y2R4 AKT1-202ENST00000402615 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.395e-6■■■■■ 32.8
DDX52Q9Y2R4 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 32.7
DDX52Q9Y2R4 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 32.6
DDX52Q9Y2R4 APBA2-209ENST00000559709 594 ntTSL 428.75■■■□□ 2.193e-6■■■■■ 32.6
DDX52Q9Y2R4 APBA2-210ENST00000559814 2555 ntTSL 1 (best)21.09■□□□□ 0.973e-6■■■■■ 32.6
DDX52Q9Y2R4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.573e-6■■■■■ 32.6
DDX52Q9Y2R4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 32.6
DDX52Q9Y2R4 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 32.6
DDX52Q9Y2R4 AKT1-215ENST00000555926 553 ntTSL 323.15■■□□□ 1.35e-6■■■■■ 32.6
DDX52Q9Y2R4 CCNY-209ENST00000493157 816 ntTSL 520.25■□□□□ 0.833e-7■■■■■ 32.5
DDX52Q9Y2R4 CCNY-207ENST00000490012 793 ntTSL 318.21■□□□□ 0.513e-7■■■■■ 32.5
DDX52Q9Y2R4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.343e-7■■■■■ 32.5
DDX52Q9Y2R4 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 32.5
DDX52Q9Y2R4 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.083e-7■■■■■ 32.5
DDX52Q9Y2R4 CCNY-204ENST00000374706 3940 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.583e-7■■■■■ 32.5
DDX52Q9Y2R4 CCNY-208ENST00000492478 809 ntTSL 510.63□□□□□ -0.713e-7■■■■■ 32.5
DDX52Q9Y2R4 CCNY-206ENST00000470025 346 ntTSL 54.87□□□□□ -1.633e-7■■■■■ 32.5
DDX52Q9Y2R4 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.052e-10■■■■■ 32.3
DDX52Q9Y2R4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.461e-6■■■■■ 32.2
DDX52Q9Y2R4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.963e-12■■■■■ 32.2
DDX52Q9Y2R4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.913e-12■■■■■ 32.2
DDX52Q9Y2R4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.573e-10■■■■■ 32.2
DDX52Q9Y2R4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.364e-7■■■■■ 32.2
DDX52Q9Y2R4 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.134e-7■■■■■ 32.2
DDX52Q9Y2R4 TGIF1-203ENST00000345133 1088 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.763e-10■■■■■ 32.2
DDX52Q9Y2R4 TGIF1-214ENST00000549546 820 ntTSL 55.92□□□□□ -1.463e-10■■■■■ 32.2
DDX52Q9Y2R4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.892e-6■■■■■ 32
DDX52Q9Y2R4 PIP5K1C-208ENST00000637724 435 ntTSL 323.94■■□□□ 1.422e-6■■■■■ 32
DDX52Q9Y2R4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 32
DDX52Q9Y2R4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 32
DDX52Q9Y2R4 PIP5K1C-204ENST00000587482 1311 ntTSL 519.32■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 32
DDX52Q9Y2R4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 32
DDX52Q9Y2R4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.847e-8■■■■■ 31.7
DDX52Q9Y2R4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.737e-8■■■■■ 31.7
DDX52Q9Y2R4 GPX3-206ENST00000521632 1314 ntTSL 518.23■□□□□ 0.517e-8■■■■■ 31.7
DDX52Q9Y2R4 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.337e-8■■■■■ 31.7
DDX52Q9Y2R4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.46■■□□□ 1.191e-6■■■■■ 31.7
DDX52Q9Y2R4 ZFYVE28-205ENST00000508184 541 ntTSL 420.54■□□□□ 0.883e-6■■■■■ 31.7
DDX52Q9Y2R4 ADARB1-203ENST00000389861 5031 ntTSL 1 (best)22.98■■□□□ 1.271e-6■■■■■ 31.5
DDX52Q9Y2R4 ADARB1-212ENST00000496664 5033 ntTSL 1 (best)22.98■■□□□ 1.271e-6■■■■■ 31.5
DDX52Q9Y2R4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.271e-6■■■■■ 31.5
DDX52Q9Y2R4 ADARB1-211ENST00000492414 4913 ntTSL 1 (best)22.11■■□□□ 1.131e-6■■■■■ 31.5
DDX52Q9Y2R4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.661e-6■■■■■ 31.5
DDX52Q9Y2R4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 31.5
DDX52Q9Y2R4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.342e-10■■■■■ 31.4
DDX52Q9Y2R4 UBE2J2-213ENST00000471154 336 ntTSL 53.14□□□□□ -1.913e-7■■■■■ 31.2
DDX52Q9Y2R4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.782e-7■■■■■ 31.2
DDX52Q9Y2R4 ZYX-202ENST00000354434 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.22■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 31.2
DDX52Q9Y2R4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.522e-10■■■■■ 31.1
DDX52Q9Y2R4 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.881e-323■■■■■ 31.1
DDX52Q9Y2R4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.663e-6■■■■■ 31
DDX52Q9Y2R4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.246e-7■■■■■ 31
DDX52Q9Y2R4 GNA11-203ENST00000586763 354 ntTSL 318.85■□□□□ 0.616e-7■■■■■ 31
DDX52Q9Y2R4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.271e-7■■■■■ 30.8
DDX52Q9Y2R4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.961e-7■■■■■ 30.8
DDX52Q9Y2R4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.741e-7■■■■■ 30.8
DDX52Q9Y2R4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.911e-7■■■■■ 30.8
DDX52Q9Y2R4 OSBPL5-205ENST00000465323 674 ntTSL 224.59■■□□□ 1.539e-7■■■■■ 30.8
DDX52Q9Y2R4 OSBPL5-206ENST00000471998 2182 ntTSL 222.51■■□□□ 1.199e-7■■■■■ 30.8
DDX52Q9Y2R4 OSBPL5-212ENST00000528124 567 ntTSL 421.88■■□□□ 1.099e-7■■■■■ 30.8
DDX52Q9Y2R4 OSBPL5-215ENST00000533234 554 ntTSL 419.93■□□□□ 0.789e-7■■■■■ 30.8
DDX52Q9Y2R4 OSBPL5-219ENST00000534491 2224 ntTSL 1 (best)18.8■□□□□ 0.69e-7■■■■■ 30.8
DDX52Q9Y2R4 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.339e-7■■■■■ 30.8
DDX52Q9Y2R4 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.259e-7■■■■■ 30.8
DDX52Q9Y2R4 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.059e-7■■■■■ 30.8
DDX52Q9Y2R4 OSBPL5-213ENST00000530372 575 ntTSL 414.71□□□□□ -0.059e-7■■■■■ 30.8
DDX52Q9Y2R4 FBRSL1-204ENST00000539264 409 ntTSL 228.45■■■□□ 2.143e-6■■■■■ 30.6
DDX52Q9Y2R4 FBRSL1-207ENST00000543360 238 ntTSL 228.16■■■□□ 2.13e-6■■■■■ 30.6
DDX52Q9Y2R4 GET4-206ENST00000464468 676 ntTSL 320.78■□□□□ 0.922e-12■■■■■ 30.5
DDX52Q9Y2R4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.515e-6■■■■■ 30.5
DDX52Q9Y2R4 SPPL2B-203ENST00000586332 496 ntTSL 319.22■□□□□ 0.673e-6■■■■■ 30.4
DDX52Q9Y2R4 INS-IGF2-205ENST00000641326 2861 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.238e-13■■■■■ 30.4
DDX52Q9Y2R4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.994e-6■■■■■ 30.3
DDX52Q9Y2R4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.694e-6■■■■■ 30.3
DDX52Q9Y2R4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.294e-6■■■■■ 30.3
DDX52Q9Y2R4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.134e-6■■■■■ 30.3
DDX52Q9Y2R4 FOSL1-205ENST00000534222 584 ntTSL 316■□□□□ 0.154e-6■■■■■ 30.3
DDX52Q9Y2R4 MTCO1P2-201ENST00000554243 703 ntBASIC10.17□□□□□ -0.781e-9■■■■■ 30.3
DDX52Q9Y2R4 SDF4-206ENST00000478938 2591 ntTSL 222.39■■□□□ 1.171e-6■■■■■ 30.1
Retrieved 100 of 4,483 protein–RNA pairs in 86 ms