Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF346Q9UL40 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF346Q9UL40 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF346Q9UL40 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF346Q9UL40 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF346Q9UL40 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF346Q9UL40 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF346Q9UL40 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF346Q9UL40 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF346Q9UL40 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF346Q9UL40 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF346Q9UL40 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF346Q9UL40 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF346Q9UL40 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF346Q9UL40 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF346Q9UL40 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF346Q9UL40 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF346Q9UL40 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF346Q9UL40 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF346Q9UL40 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF346Q9UL40 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF346Q9UL40 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF346Q9UL40 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms