Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZB2

FAM120A, Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM120AQ9NZB2 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.337e-10■■■■■ 40.6
FAM120AQ9NZB2 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.367e-10■■■■■ 40.6
FAM120AQ9NZB2 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.677e-10■■■■■ 40.6
FAM120AQ9NZB2 ATP11A-209ENST00000466946 431 ntTSL 57.74□□□□□ -1.177e-10■■■■■ 40.6
FAM120AQ9NZB2 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.182e-20■■■■■ 40.5
FAM120AQ9NZB2 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.062e-20■■■■■ 40.5
FAM120AQ9NZB2 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.042e-20■■■■■ 40.5
FAM120AQ9NZB2 NMT1-213ENST00000592782 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.354e-9■■■■■ 40.4
FAM120AQ9NZB2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.972e-8■■■■■ 40.2
FAM120AQ9NZB2 ZNF444-212ENST00000593100 562 ntTSL 222.61■■□□□ 1.216e-11■■■■■ 40
FAM120AQ9NZB2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.358e-11■■■■■ 40
FAM120AQ9NZB2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.178e-11■■■■■ 40
FAM120AQ9NZB2 RPL36-207ENST00000582463 239 ntTSL 521.85■■□□□ 1.091e-11■■■■■ 40
FAM120AQ9NZB2 RPL36-208ENST00000590786 907 ntTSL 221.53■■□□□ 1.041e-11■■■■■ 40
FAM120AQ9NZB2 SIPA1L3-202ENST00000476317 608 ntTSL 320.63■□□□□ 0.891e-11■■■■■ 40
FAM120AQ9NZB2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.71e-11■■■■■ 40
FAM120AQ9NZB2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.241e-11■■■■■ 40
FAM120AQ9NZB2 NASP-208ENST00000470768 1036 ntTSL 314.76□□□□□ -0.051e-11■■■■■ 40
FAM120AQ9NZB2 NASP-207ENST00000464190 604 ntTSL 214.67□□□□□ -0.061e-11■■■■■ 40
FAM120AQ9NZB2 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.181e-11■■■■■ 40
FAM120AQ9NZB2 NASP-217ENST00000529333 778 ntTSL 412.49□□□□□ -0.411e-11■■■■■ 40
FAM120AQ9NZB2 NASP-219ENST00000530840 531 ntTSL 512.49□□□□□ -0.411e-11■■■■■ 40
FAM120AQ9NZB2 NASP-213ENST00000527470 532 ntTSL 412.49□□□□□ -0.411e-11■■■■■ 40
FAM120AQ9NZB2 NASP-211ENST00000525515 565 ntTSL 512.49□□□□□ -0.411e-11■■■■■ 40
FAM120AQ9NZB2 NASP-220ENST00000531532 554 ntTSL 412.49□□□□□ -0.411e-11■■■■■ 40
FAM120AQ9NZB2 NASP-205ENST00000437901 874 ntTSL 512.47□□□□□ -0.411e-11■■■■■ 40
FAM120AQ9NZB2 NASP-204ENST00000437362 999 ntTSL 212.44□□□□□ -0.421e-11■■■■■ 40
FAM120AQ9NZB2 NASP-212ENST00000527359 743 ntTSL 312.38□□□□□ -0.431e-11■■■■■ 40
FAM120AQ9NZB2 RPL36-204ENST00000579446 452 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.481e-11■■■■■ 40
FAM120AQ9NZB2 NASP-225ENST00000629893 253 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.51e-11■■■■■ 40
FAM120AQ9NZB2 NASP-215ENST00000528084 535 ntTSL 411.93□□□□□ -0.51e-11■■■■■ 40
FAM120AQ9NZB2 NASP-202ENST00000351223 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.671e-11■■■■■ 40
FAM120AQ9NZB2 NASP-206ENST00000453748 2080 ntTSL 210.49□□□□□ -0.731e-11■■■■■ 40
FAM120AQ9NZB2 RPL36-205ENST00000579649 449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.771e-11■■■■■ 40
FAM120AQ9NZB2 NASP-216ENST00000528238 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.25□□□□□ -0.771e-11■■■■■ 40
FAM120AQ9NZB2 NASP-224ENST00000537798 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.951e-11■■■■■ 40
FAM120AQ9NZB2 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.021e-11■■■■■ 40
FAM120AQ9NZB2 NASP-203ENST00000372052 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.121e-11■■■■■ 40
FAM120AQ9NZB2 NASP-222ENST00000534101 754 ntTSL 34.95□□□□□ -1.621e-11■■■■■ 40
FAM120AQ9NZB2 LMNB2-203ENST00000490554 689 ntTSL 217.26■□□□□ 0.351e-7■■■■■ 39.9
FAM120AQ9NZB2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.834e-7■■■■■ 39.9
FAM120AQ9NZB2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.754e-7■■■■■ 39.9
FAM120AQ9NZB2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.34e-7■■■■■ 39.9
FAM120AQ9NZB2 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.194e-7■■■■■ 39.9
FAM120AQ9NZB2 SNAP47-207ENST00000475930 792 ntTSL 315.24■□□□□ 0.034e-7■■■■■ 39.9
FAM120AQ9NZB2 SNAP47-204ENST00000418653 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)12.91□□□□□ -0.344e-7■■■■■ 39.9
FAM120AQ9NZB2 SNAP47-205ENST00000426344 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 212.77□□□□□ -0.374e-7■■■■■ 39.9
FAM120AQ9NZB2 SNAP47-211ENST00000491439 734 ntTSL 311.07□□□□□ -0.644e-7■■■■■ 39.9
FAM120AQ9NZB2 ENTPD2-204ENST00000469106 868 ntTSL 522.1■■□□□ 1.133e-11■■■■■ 39.9
FAM120AQ9NZB2 EIPR1-212ENST00000478754 2932 ntTSL 517.71■□□□□ 0.435e-7■■■■■ 39.6
FAM120AQ9NZB2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.047e-9■■■■■ 39.6
FAM120AQ9NZB2 HMGB1-202ENST00000339872 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.185e-9■■■■■ 39.6
FAM120AQ9NZB2 HMGB1-206ENST00000405805 4199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.45e-9■■■■■ 39.6
FAM120AQ9NZB2 HMGB1-203ENST00000341423 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.985e-9■■■■■ 39.6
FAM120AQ9NZB2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 39.5
FAM120AQ9NZB2 B3GNTL1-206ENST00000571954 881 ntTSL 515.16■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 39.5
FAM120AQ9NZB2 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 39.5
FAM120AQ9NZB2 B3GNTL1-202ENST00000570947 390 ntTSL 312.17□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 39.5
FAM120AQ9NZB2 DBNDD1-205ENST00000568662 563 ntTSL 218.04■□□□□ 0.486e-9■■■■■ 39.5
FAM120AQ9NZB2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.266e-9■■■■■ 39.5
FAM120AQ9NZB2 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.016e-9■■■■■ 39.5
FAM120AQ9NZB2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.616e-11■■■■■ 39.5
FAM120AQ9NZB2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.586e-11■■■■■ 39.5
FAM120AQ9NZB2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.446e-11■■■■■ 39.5
FAM120AQ9NZB2 TCF3-211ENST00000587425 629 ntTSL 216.73■□□□□ 0.276e-11■■■■■ 39.5
FAM120AQ9NZB2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.246e-11■■■■■ 39.5
FAM120AQ9NZB2 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.076e-11■■■■■ 39.5
FAM120AQ9NZB2 ABHD4-204ENST00000489928 507 ntTSL 313.89□□□□□ -0.197e-8■■■■■ 39.4
FAM120AQ9NZB2 ABHD4-203ENST00000428304 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.987e-8■■■■■ 39.4
FAM120AQ9NZB2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.022e-6■■■■■ 39.3
FAM120AQ9NZB2 TAF5L-205ENST00000477957 509 ntTSL 331.64■■■□□ 2.662e-6■■■■■ 39.3
FAM120AQ9NZB2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 39.3
FAM120AQ9NZB2 TAF5L-203ENST00000366675 4062 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 39.3
FAM120AQ9NZB2 SEPT9-226ENST00000589920 580 ntTSL 216.09■□□□□ 0.175e-8■■■■■ 39.3
FAM120AQ9NZB2 SEPT9-209ENST00000585638 565 ntTSL 415.34■□□□□ 0.055e-8■■■■■ 39.3
FAM120AQ9NZB2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.556e-7■■■■■ 39.3
FAM120AQ9NZB2 KNOP1-204ENST00000567367 595 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.65□□□□□ -0.226e-7■■■■■ 39.3
FAM120AQ9NZB2 KNOP1-201ENST00000219837 6432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.556e-7■■■■■ 39.3
FAM120AQ9NZB2 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.461e-6■■■■■ 39.3
FAM120AQ9NZB2 FOXK2-211ENST00000575578 571 ntTSL 215.45■□□□□ 0.069e-12■■■■■ 39.3
FAM120AQ9NZB2 CORO1C-215ENST00000551044 567 ntTSL 38.05□□□□□ -1.126e-23■■■■■ 39.2
FAM120AQ9NZB2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.556e-8■■■■■ 39.2
FAM120AQ9NZB2 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.076e-8■■■■■ 39.2
FAM120AQ9NZB2 PPP2R3B-203ENST00000445792 1998 ntTSL 227.8■■■□□ 2.047e-7■■■■■ 39.2
FAM120AQ9NZB2 PPP2R3B-201ENST00000381625 782 ntTSL 522.63■■□□□ 1.217e-7■■■■■ 39.2
FAM120AQ9NZB2 COG8-202ENST00000562595 2262 ntTSL 521.91■■□□□ 1.12e-11■■■■■ 39.1
FAM120AQ9NZB2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.112e-11■■■■■ 39.1
FAM120AQ9NZB2 COG8-207ENST00000562949 887 ntTSL 315.18■□□□□ 0.022e-11■■■■■ 39.1
FAM120AQ9NZB2 MTHFD1L-209ENST00000453602 503 ntTSL 58.67□□□□□ -1.022e-11■■■■■ 39.1
FAM120AQ9NZB2 MTHFD1L-208ENST00000450635 427 ntTSL 58.32□□□□□ -1.082e-11■■■■■ 39.1
FAM120AQ9NZB2 C10orf10-203ENST00000496638 868 ntTSL 323.09■■□□□ 1.298e-21■■■■■ 38.9
FAM120AQ9NZB2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.524e-8■■■■■ 38.9
FAM120AQ9NZB2 GNAS-256ENST00000603546 573 ntTSL 529.89■■■□□ 2.381e-14■■■■■ 38.9
FAM120AQ9NZB2 SNX12-201ENST00000276105 720 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.634e-11■■■■■ 38.8
FAM120AQ9NZB2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.675e-7■■■■■ 38.7
FAM120AQ9NZB2 MROH1-205ENST00000527552 5832 ntTSL 1 (best)13.38□□□□□ -0.275e-7■■■■■ 38.7
FAM120AQ9NZB2 MROH1-208ENST00000532255 3905 ntTSL 212.32□□□□□ -0.445e-7■■■■■ 38.7
FAM120AQ9NZB2 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.015e-9■■■■■ 38.7
FAM120AQ9NZB2 PTK2-234ENST00000521791 556 ntTSL 49.76□□□□□ -0.855e-9■■■■■ 38.7
FAM120AQ9NZB2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.694e-7■■■■■ 38.7
Retrieved 100 of 20,049 protein–RNA pairs in 264.8 ms