Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWZ3

IRAK4, Interleukin-1 receptor-associated kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRAK4Q9NWZ3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRAK4Q9NWZ3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRAK4Q9NWZ3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRAK4Q9NWZ3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRAK4Q9NWZ3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRAK4Q9NWZ3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRAK4Q9NWZ3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRAK4Q9NWZ3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRAK4Q9NWZ3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRAK4Q9NWZ3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRAK4Q9NWZ3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRAK4Q9NWZ3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRAK4Q9NWZ3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRAK4Q9NWZ3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRAK4Q9NWZ3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRAK4Q9NWZ3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRAK4Q9NWZ3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRAK4Q9NWZ3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRAK4Q9NWZ3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRAK4Q9NWZ3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRAK4Q9NWZ3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRAK4Q9NWZ3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRAK4Q9NWZ3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRAK4Q9NWZ3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRAK4Q9NWZ3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRAK4Q9NWZ3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRAK4Q9NWZ3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRAK4Q9NWZ3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRAK4Q9NWZ3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRAK4Q9NWZ3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
IRAK4Q9NWZ3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRAK4Q9NWZ3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRAK4Q9NWZ3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IRAK4Q9NWZ3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IRAK4Q9NWZ3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRAK4Q9NWZ3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRAK4Q9NWZ3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRAK4Q9NWZ3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRAK4Q9NWZ3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRAK4Q9NWZ3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRAK4Q9NWZ3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRAK4Q9NWZ3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRAK4Q9NWZ3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
IRAK4Q9NWZ3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRAK4Q9NWZ3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRAK4Q9NWZ3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRAK4Q9NWZ3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRAK4Q9NWZ3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRAK4Q9NWZ3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRAK4Q9NWZ3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRAK4Q9NWZ3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRAK4Q9NWZ3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRAK4Q9NWZ3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRAK4Q9NWZ3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRAK4Q9NWZ3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRAK4Q9NWZ3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRAK4Q9NWZ3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRAK4Q9NWZ3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRAK4Q9NWZ3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms