Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MID1IP1Q9NPA3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MID1IP1Q9NPA3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MID1IP1Q9NPA3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MID1IP1Q9NPA3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MID1IP1Q9NPA3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MID1IP1Q9NPA3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MID1IP1Q9NPA3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MID1IP1Q9NPA3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms