Protein–RNA interactions for Protein: Q96RN5

MED15, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED15Q96RN5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED15Q96RN5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED15Q96RN5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MED15Q96RN5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MED15Q96RN5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MED15Q96RN5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MED15Q96RN5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MED15Q96RN5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MED15Q96RN5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MED15Q96RN5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MED15Q96RN5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MED15Q96RN5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MED15Q96RN5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MED15Q96RN5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MED15Q96RN5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MED15Q96RN5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MED15Q96RN5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MED15Q96RN5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MED15Q96RN5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MED15Q96RN5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MED15Q96RN5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MED15Q96RN5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MED15Q96RN5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MED15Q96RN5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MED15Q96RN5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MED15Q96RN5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MED15Q96RN5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MED15Q96RN5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MED15Q96RN5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MED15Q96RN5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MED15Q96RN5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MED15Q96RN5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MED15Q96RN5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MED15Q96RN5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MED15Q96RN5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MED15Q96RN5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MED15Q96RN5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MED15Q96RN5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MED15Q96RN5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MED15Q96RN5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MED15Q96RN5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MED15Q96RN5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MED15Q96RN5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MED15Q96RN5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MED15Q96RN5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MED15Q96RN5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MED15Q96RN5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MED15Q96RN5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MED15Q96RN5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MED15Q96RN5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MED15Q96RN5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MED15Q96RN5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MED15Q96RN5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MED15Q96RN5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MED15Q96RN5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MED15Q96RN5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MED15Q96RN5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MED15Q96RN5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MED15Q96RN5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MED15Q96RN5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MED15Q96RN5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MED15Q96RN5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MED15Q96RN5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MED15Q96RN5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MED15Q96RN5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MED15Q96RN5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MED15Q96RN5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MED15Q96RN5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MED15Q96RN5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MED15Q96RN5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MED15Q96RN5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MED15Q96RN5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
MED15Q96RN5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MED15Q96RN5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MED15Q96RN5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MED15Q96RN5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MED15Q96RN5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MED15Q96RN5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MED15Q96RN5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MED15Q96RN5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MED15Q96RN5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MED15Q96RN5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MED15Q96RN5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MED15Q96RN5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MED15Q96RN5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MED15Q96RN5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MED15Q96RN5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MED15Q96RN5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MED15Q96RN5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MED15Q96RN5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MED15Q96RN5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MED15Q96RN5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MED15Q96RN5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MED15Q96RN5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MED15Q96RN5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MED15Q96RN5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MED15Q96RN5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MED15Q96RN5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MED15Q96RN5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MED15Q96RN5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms