Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU5

NEDD4L, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4LQ96PU5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD4LQ96PU5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD4LQ96PU5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD4LQ96PU5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD4LQ96PU5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD4LQ96PU5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD4LQ96PU5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD4LQ96PU5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4LQ96PU5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4LQ96PU5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4LQ96PU5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4LQ96PU5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4LQ96PU5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4LQ96PU5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD4LQ96PU5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD4LQ96PU5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD4LQ96PU5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD4LQ96PU5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD4LQ96PU5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD4LQ96PU5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD4LQ96PU5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD4LQ96PU5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD4LQ96PU5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD4LQ96PU5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD4LQ96PU5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NEDD4LQ96PU5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD4LQ96PU5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD4LQ96PU5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD4LQ96PU5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD4LQ96PU5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD4LQ96PU5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD4LQ96PU5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD4LQ96PU5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD4LQ96PU5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD4LQ96PU5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD4LQ96PU5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4LQ96PU5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4LQ96PU5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4LQ96PU5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4LQ96PU5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4LQ96PU5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD4LQ96PU5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD4LQ96PU5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD4LQ96PU5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD4LQ96PU5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD4LQ96PU5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD4LQ96PU5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD4LQ96PU5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD4LQ96PU5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD4LQ96PU5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD4LQ96PU5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD4LQ96PU5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD4LQ96PU5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD4LQ96PU5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4LQ96PU5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4LQ96PU5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD4LQ96PU5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD4LQ96PU5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD4LQ96PU5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD4LQ96PU5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD4LQ96PU5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD4LQ96PU5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD4LQ96PU5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD4LQ96PU5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD4LQ96PU5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD4LQ96PU5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD4LQ96PU5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD4LQ96PU5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD4LQ96PU5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4LQ96PU5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4LQ96PU5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4LQ96PU5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4LQ96PU5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4LQ96PU5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD4LQ96PU5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD4LQ96PU5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD4LQ96PU5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1661.5 ms