Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PRAC1Q96KF2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PRAC1Q96KF2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PRAC1Q96KF2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PRAC1Q96KF2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PRAC1Q96KF2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PRAC1Q96KF2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PRAC1Q96KF2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PRAC1Q96KF2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PRAC1Q96KF2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PRAC1Q96KF2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms