Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSPAN17Q96FV3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPAN17Q96FV3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPAN17Q96FV3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPAN17Q96FV3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPAN17Q96FV3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPAN17Q96FV3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPAN17Q96FV3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPAN17Q96FV3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPAN17Q96FV3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPAN17Q96FV3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPAN17Q96FV3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN17Q96FV3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN17Q96FV3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN17Q96FV3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSPAN17Q96FV3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSPAN17Q96FV3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSPAN17Q96FV3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSPAN17Q96FV3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSPAN17Q96FV3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPAN17Q96FV3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPAN17Q96FV3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPAN17Q96FV3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN17Q96FV3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN17Q96FV3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN17Q96FV3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN17Q96FV3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN17Q96FV3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN17Q96FV3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN17Q96FV3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN17Q96FV3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSPAN17Q96FV3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSPAN17Q96FV3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSPAN17Q96FV3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN17Q96FV3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN17Q96FV3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN17Q96FV3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN17Q96FV3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN17Q96FV3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN17Q96FV3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN17Q96FV3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN17Q96FV3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN17Q96FV3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN17Q96FV3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN17Q96FV3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN17Q96FV3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN17Q96FV3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN17Q96FV3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN17Q96FV3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN17Q96FV3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN17Q96FV3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN17Q96FV3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN17Q96FV3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN17Q96FV3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN17Q96FV3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN17Q96FV3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN17Q96FV3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN17Q96FV3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN17Q96FV3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN17Q96FV3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN17Q96FV3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN17Q96FV3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN17Q96FV3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN17Q96FV3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN17Q96FV3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN17Q96FV3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN17Q96FV3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN17Q96FV3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms