Protein–RNA interactions for Protein: Q96AX1

VPS33A, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS33AQ96AX1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS33AQ96AX1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS33AQ96AX1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS33AQ96AX1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS33AQ96AX1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS33AQ96AX1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS33AQ96AX1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS33AQ96AX1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS33AQ96AX1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS33AQ96AX1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS33AQ96AX1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS33AQ96AX1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS33AQ96AX1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS33AQ96AX1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS33AQ96AX1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS33AQ96AX1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS33AQ96AX1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS33AQ96AX1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS33AQ96AX1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS33AQ96AX1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS33AQ96AX1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS33AQ96AX1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS33AQ96AX1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS33AQ96AX1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS33AQ96AX1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS33AQ96AX1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS33AQ96AX1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS33AQ96AX1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS33AQ96AX1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS33AQ96AX1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS33AQ96AX1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS33AQ96AX1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS33AQ96AX1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS33AQ96AX1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS33AQ96AX1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS33AQ96AX1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS33AQ96AX1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS33AQ96AX1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS33AQ96AX1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS33AQ96AX1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS33AQ96AX1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS33AQ96AX1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS33AQ96AX1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS33AQ96AX1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS33AQ96AX1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS33AQ96AX1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS33AQ96AX1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS33AQ96AX1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS33AQ96AX1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS33AQ96AX1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS33AQ96AX1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS33AQ96AX1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS33AQ96AX1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS33AQ96AX1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS33AQ96AX1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS33AQ96AX1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS33AQ96AX1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS33AQ96AX1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS33AQ96AX1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VPS33AQ96AX1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VPS33AQ96AX1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS33AQ96AX1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS33AQ96AX1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS33AQ96AX1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS33AQ96AX1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS33AQ96AX1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS33AQ96AX1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS33AQ96AX1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS33AQ96AX1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS33AQ96AX1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS33AQ96AX1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS33AQ96AX1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS33AQ96AX1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS33AQ96AX1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS33AQ96AX1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS33AQ96AX1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS33AQ96AX1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS33AQ96AX1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS33AQ96AX1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS33AQ96AX1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS33AQ96AX1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS33AQ96AX1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS33AQ96AX1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS33AQ96AX1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS33AQ96AX1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS33AQ96AX1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS33AQ96AX1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS33AQ96AX1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS33AQ96AX1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS33AQ96AX1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS33AQ96AX1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS33AQ96AX1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS33AQ96AX1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS33AQ96AX1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS33AQ96AX1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS33AQ96AX1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS33AQ96AX1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS33AQ96AX1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS33AQ96AX1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS33AQ96AX1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms