Protein–RNA interactions for Protein: Q92560

BAP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BAP1Q92560 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BAP1Q92560 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BAP1Q92560 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BAP1Q92560 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BAP1Q92560 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BAP1Q92560 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
BAP1Q92560 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BAP1Q92560 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
BAP1Q92560 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BAP1Q92560 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BAP1Q92560 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BAP1Q92560 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BAP1Q92560 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BAP1Q92560 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BAP1Q92560 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BAP1Q92560 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BAP1Q92560 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BAP1Q92560 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BAP1Q92560 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BAP1Q92560 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BAP1Q92560 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BAP1Q92560 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BAP1Q92560 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BAP1Q92560 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BAP1Q92560 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BAP1Q92560 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BAP1Q92560 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BAP1Q92560 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BAP1Q92560 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BAP1Q92560 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
BAP1Q92560 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BAP1Q92560 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BAP1Q92560 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BAP1Q92560 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BAP1Q92560 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BAP1Q92560 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BAP1Q92560 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BAP1Q92560 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BAP1Q92560 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BAP1Q92560 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BAP1Q92560 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BAP1Q92560 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BAP1Q92560 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BAP1Q92560 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BAP1Q92560 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BAP1Q92560 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BAP1Q92560 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
BAP1Q92560 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BAP1Q92560 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BAP1Q92560 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BAP1Q92560 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BAP1Q92560 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
BAP1Q92560 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BAP1Q92560 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BAP1Q92560 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
BAP1Q92560 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BAP1Q92560 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BAP1Q92560 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BAP1Q92560 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BAP1Q92560 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BAP1Q92560 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BAP1Q92560 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BAP1Q92560 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BAP1Q92560 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BAP1Q92560 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BAP1Q92560 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BAP1Q92560 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BAP1Q92560 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
BAP1Q92560 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BAP1Q92560 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BAP1Q92560 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BAP1Q92560 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BAP1Q92560 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BAP1Q92560 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BAP1Q92560 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
BAP1Q92560 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BAP1Q92560 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BAP1Q92560 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BAP1Q92560 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BAP1Q92560 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
BAP1Q92560 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BAP1Q92560 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BAP1Q92560 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BAP1Q92560 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BAP1Q92560 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BAP1Q92560 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BAP1Q92560 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BAP1Q92560 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
BAP1Q92560 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BAP1Q92560 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BAP1Q92560 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BAP1Q92560 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BAP1Q92560 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BAP1Q92560 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BAP1Q92560 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BAP1Q92560 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BAP1Q92560 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BAP1Q92560 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BAP1Q92560 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BAP1Q92560 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.5 ms