Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
FSIP1Q8NA03 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FSIP1Q8NA03 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FSIP1Q8NA03 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FSIP1Q8NA03 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FSIP1Q8NA03 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FSIP1Q8NA03 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FSIP1Q8NA03 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FSIP1Q8NA03 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FSIP1Q8NA03 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FSIP1Q8NA03 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FSIP1Q8NA03 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FSIP1Q8NA03 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FSIP1Q8NA03 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FSIP1Q8NA03 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FSIP1Q8NA03 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
FSIP1Q8NA03 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FSIP1Q8NA03 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FSIP1Q8NA03 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FSIP1Q8NA03 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms