Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP9Q8IXQ6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP9Q8IXQ6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP9Q8IXQ6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP9Q8IXQ6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP9Q8IXQ6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP9Q8IXQ6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARP9Q8IXQ6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARP9Q8IXQ6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PARP9Q8IXQ6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARP9Q8IXQ6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP9Q8IXQ6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP9Q8IXQ6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP9Q8IXQ6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP9Q8IXQ6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP9Q8IXQ6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP9Q8IXQ6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP9Q8IXQ6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP9Q8IXQ6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP9Q8IXQ6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP9Q8IXQ6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP9Q8IXQ6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP9Q8IXQ6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP9Q8IXQ6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP9Q8IXQ6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP9Q8IXQ6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP9Q8IXQ6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP9Q8IXQ6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP9Q8IXQ6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP9Q8IXQ6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP9Q8IXQ6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP9Q8IXQ6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP9Q8IXQ6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP9Q8IXQ6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP9Q8IXQ6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP9Q8IXQ6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP9Q8IXQ6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP9Q8IXQ6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP9Q8IXQ6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP9Q8IXQ6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP9Q8IXQ6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP9Q8IXQ6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP9Q8IXQ6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP9Q8IXQ6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP9Q8IXQ6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP9Q8IXQ6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP9Q8IXQ6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP9Q8IXQ6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP9Q8IXQ6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP9Q8IXQ6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP9Q8IXQ6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP9Q8IXQ6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP9Q8IXQ6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP9Q8IXQ6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP9Q8IXQ6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP9Q8IXQ6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP9Q8IXQ6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP9Q8IXQ6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP9Q8IXQ6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP9Q8IXQ6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP9Q8IXQ6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP9Q8IXQ6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP9Q8IXQ6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP9Q8IXQ6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP9Q8IXQ6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP9Q8IXQ6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PARP9Q8IXQ6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PARP9Q8IXQ6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP9Q8IXQ6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP9Q8IXQ6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP9Q8IXQ6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP9Q8IXQ6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP9Q8IXQ6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP9Q8IXQ6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP9Q8IXQ6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP9Q8IXQ6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP9Q8IXQ6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP9Q8IXQ6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP9Q8IXQ6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP9Q8IXQ6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP9Q8IXQ6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP9Q8IXQ6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP9Q8IXQ6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARP9Q8IXQ6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARP9Q8IXQ6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARP9Q8IXQ6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP9Q8IXQ6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP9Q8IXQ6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP9Q8IXQ6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP9Q8IXQ6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP9Q8IXQ6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP9Q8IXQ6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP9Q8IXQ6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARP9Q8IXQ6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms