Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM225Q6GV28 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM225Q6GV28 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM225Q6GV28 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM225Q6GV28 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM225Q6GV28 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM225Q6GV28 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM225Q6GV28 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM225Q6GV28 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM225Q6GV28 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM225Q6GV28 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM225Q6GV28 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM225Q6GV28 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM225Q6GV28 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM225Q6GV28 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM225Q6GV28 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM225Q6GV28 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM225Q6GV28 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM225Q6GV28 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM225Q6GV28 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM225Q6GV28 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM225Q6GV28 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM225Q6GV28 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM225Q6GV28 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM225Q6GV28 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM225Q6GV28 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM225Q6GV28 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM225Q6GV28 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM225Q6GV28 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM225Q6GV28 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM225Q6GV28 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM225Q6GV28 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM225Q6GV28 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM225Q6GV28 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM225Q6GV28 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM225Q6GV28 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM225Q6GV28 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM225Q6GV28 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM225Q6GV28 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM225Q6GV28 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM225Q6GV28 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM225Q6GV28 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM225Q6GV28 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM225Q6GV28 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM225Q6GV28 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM225Q6GV28 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM225Q6GV28 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM225Q6GV28 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM225Q6GV28 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM225Q6GV28 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM225Q6GV28 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM225Q6GV28 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM225Q6GV28 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM225Q6GV28 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM225Q6GV28 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM225Q6GV28 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM225Q6GV28 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM225Q6GV28 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM225Q6GV28 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM225Q6GV28 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM225Q6GV28 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM225Q6GV28 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM225Q6GV28 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM225Q6GV28 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM225Q6GV28 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM225Q6GV28 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM225Q6GV28 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM225Q6GV28 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM225Q6GV28 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM225Q6GV28 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM225Q6GV28 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM225Q6GV28 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM225Q6GV28 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM225Q6GV28 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM225Q6GV28 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM225Q6GV28 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM225Q6GV28 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM225Q6GV28 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM225Q6GV28 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM225Q6GV28 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM225Q6GV28 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM225Q6GV28 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM225Q6GV28 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM225Q6GV28 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM225Q6GV28 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM225Q6GV28 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM225Q6GV28 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM225Q6GV28 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM225Q6GV28 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM225Q6GV28 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM225Q6GV28 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM225Q6GV28 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM225Q6GV28 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM225Q6GV28 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM225Q6GV28 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM225Q6GV28 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM225Q6GV28 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM225Q6GV28 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM225Q6GV28 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM225Q6GV28 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms