Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF220Q5VTB9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF220Q5VTB9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF220Q5VTB9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF220Q5VTB9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF220Q5VTB9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF220Q5VTB9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF220Q5VTB9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF220Q5VTB9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF220Q5VTB9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF220Q5VTB9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF220Q5VTB9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF220Q5VTB9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF220Q5VTB9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF220Q5VTB9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF220Q5VTB9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF220Q5VTB9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF220Q5VTB9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF220Q5VTB9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF220Q5VTB9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF220Q5VTB9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF220Q5VTB9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF220Q5VTB9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF220Q5VTB9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF220Q5VTB9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF220Q5VTB9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF220Q5VTB9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF220Q5VTB9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF220Q5VTB9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF220Q5VTB9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF220Q5VTB9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF220Q5VTB9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF220Q5VTB9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF220Q5VTB9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF220Q5VTB9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF220Q5VTB9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF220Q5VTB9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF220Q5VTB9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF220Q5VTB9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF220Q5VTB9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF220Q5VTB9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF220Q5VTB9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF220Q5VTB9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF220Q5VTB9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF220Q5VTB9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF220Q5VTB9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF220Q5VTB9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF220Q5VTB9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF220Q5VTB9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF220Q5VTB9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF220Q5VTB9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF220Q5VTB9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF220Q5VTB9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF220Q5VTB9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF220Q5VTB9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF220Q5VTB9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF220Q5VTB9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF220Q5VTB9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF220Q5VTB9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF220Q5VTB9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF220Q5VTB9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF220Q5VTB9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF220Q5VTB9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF220Q5VTB9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF220Q5VTB9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF220Q5VTB9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF220Q5VTB9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF220Q5VTB9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF220Q5VTB9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF220Q5VTB9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF220Q5VTB9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF220Q5VTB9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF220Q5VTB9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF220Q5VTB9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF220Q5VTB9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF220Q5VTB9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF220Q5VTB9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF220Q5VTB9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms