Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VWA3BQ502W6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VWA3BQ502W6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VWA3BQ502W6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VWA3BQ502W6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VWA3BQ502W6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VWA3BQ502W6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
VWA3BQ502W6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VWA3BQ502W6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
VWA3BQ502W6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VWA3BQ502W6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VWA3BQ502W6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VWA3BQ502W6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VWA3BQ502W6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VWA3BQ502W6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VWA3BQ502W6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VWA3BQ502W6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VWA3BQ502W6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VWA3BQ502W6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VWA3BQ502W6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VWA3BQ502W6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VWA3BQ502W6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VWA3BQ502W6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VWA3BQ502W6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
VWA3BQ502W6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
VWA3BQ502W6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VWA3BQ502W6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VWA3BQ502W6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VWA3BQ502W6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VWA3BQ502W6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
VWA3BQ502W6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VWA3BQ502W6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VWA3BQ502W6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VWA3BQ502W6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VWA3BQ502W6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VWA3BQ502W6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
VWA3BQ502W6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VWA3BQ502W6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VWA3BQ502W6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VWA3BQ502W6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VWA3BQ502W6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VWA3BQ502W6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VWA3BQ502W6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VWA3BQ502W6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VWA3BQ502W6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
VWA3BQ502W6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VWA3BQ502W6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VWA3BQ502W6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VWA3BQ502W6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VWA3BQ502W6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VWA3BQ502W6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VWA3BQ502W6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
VWA3BQ502W6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VWA3BQ502W6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VWA3BQ502W6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VWA3BQ502W6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
VWA3BQ502W6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VWA3BQ502W6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VWA3BQ502W6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VWA3BQ502W6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VWA3BQ502W6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VWA3BQ502W6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VWA3BQ502W6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VWA3BQ502W6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VWA3BQ502W6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
VWA3BQ502W6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VWA3BQ502W6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VWA3BQ502W6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VWA3BQ502W6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
VWA3BQ502W6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VWA3BQ502W6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VWA3BQ502W6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
VWA3BQ502W6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
VWA3BQ502W6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VWA3BQ502W6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
VWA3BQ502W6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VWA3BQ502W6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
VWA3BQ502W6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VWA3BQ502W6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
VWA3BQ502W6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VWA3BQ502W6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
VWA3BQ502W6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VWA3BQ502W6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
VWA3BQ502W6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
VWA3BQ502W6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VWA3BQ502W6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VWA3BQ502W6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VWA3BQ502W6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VWA3BQ502W6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VWA3BQ502W6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
VWA3BQ502W6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VWA3BQ502W6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VWA3BQ502W6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VWA3BQ502W6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
VWA3BQ502W6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VWA3BQ502W6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VWA3BQ502W6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VWA3BQ502W6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VWA3BQ502W6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VWA3BQ502W6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms