Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ASIC2Q16515 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ASIC2Q16515 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ASIC2Q16515 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ASIC2Q16515 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ASIC2Q16515 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ASIC2Q16515 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ASIC2Q16515 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ASIC2Q16515 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ASIC2Q16515 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ASIC2Q16515 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ASIC2Q16515 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ASIC2Q16515 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ASIC2Q16515 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ASIC2Q16515 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ASIC2Q16515 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ASIC2Q16515 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ASIC2Q16515 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ASIC2Q16515 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ASIC2Q16515 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ASIC2Q16515 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ASIC2Q16515 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ASIC2Q16515 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ASIC2Q16515 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ASIC2Q16515 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ASIC2Q16515 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ASIC2Q16515 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ASIC2Q16515 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ASIC2Q16515 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ASIC2Q16515 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ASIC2Q16515 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ASIC2Q16515 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ASIC2Q16515 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ASIC2Q16515 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ASIC2Q16515 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ASIC2Q16515 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ASIC2Q16515 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ASIC2Q16515 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ASIC2Q16515 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ASIC2Q16515 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ASIC2Q16515 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ASIC2Q16515 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ASIC2Q16515 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ASIC2Q16515 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ASIC2Q16515 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ASIC2Q16515 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ASIC2Q16515 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ASIC2Q16515 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ASIC2Q16515 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ASIC2Q16515 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ASIC2Q16515 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ASIC2Q16515 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ASIC2Q16515 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ASIC2Q16515 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ASIC2Q16515 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ASIC2Q16515 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ASIC2Q16515 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ASIC2Q16515 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ASIC2Q16515 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ASIC2Q16515 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ASIC2Q16515 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ASIC2Q16515 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ASIC2Q16515 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ASIC2Q16515 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ASIC2Q16515 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ASIC2Q16515 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ASIC2Q16515 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ASIC2Q16515 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ASIC2Q16515 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ASIC2Q16515 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ASIC2Q16515 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ASIC2Q16515 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ASIC2Q16515 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ASIC2Q16515 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ASIC2Q16515 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ASIC2Q16515 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ASIC2Q16515 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ASIC2Q16515 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ASIC2Q16515 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ASIC2Q16515 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ASIC2Q16515 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ASIC2Q16515 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ASIC2Q16515 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ASIC2Q16515 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ASIC2Q16515 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ASIC2Q16515 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ASIC2Q16515 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ASIC2Q16515 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ASIC2Q16515 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ASIC2Q16515 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ASIC2Q16515 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ASIC2Q16515 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ASIC2Q16515 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ASIC2Q16515 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ASIC2Q16515 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ASIC2Q16515 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ASIC2Q16515 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ASIC2Q16515 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ASIC2Q16515 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ASIC2Q16515 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms