Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RYR3Q15413 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RYR3Q15413 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RYR3Q15413 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RYR3Q15413 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RYR3Q15413 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RYR3Q15413 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RYR3Q15413 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RYR3Q15413 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RYR3Q15413 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RYR3Q15413 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RYR3Q15413 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RYR3Q15413 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RYR3Q15413 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RYR3Q15413 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RYR3Q15413 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RYR3Q15413 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RYR3Q15413 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RYR3Q15413 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RYR3Q15413 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RYR3Q15413 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RYR3Q15413 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RYR3Q15413 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RYR3Q15413 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RYR3Q15413 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RYR3Q15413 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RYR3Q15413 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RYR3Q15413 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RYR3Q15413 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RYR3Q15413 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RYR3Q15413 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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