Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.211e-8■■■■■ 45.6
PCBP1Q15365 CPNE1-221ENST00000462352 625 ntTSL 213.01□□□□□ -0.331e-8■■■■■ 45.6
PCBP1Q15365 CPNE1-222ENST00000473373 821 ntTSL 212.76□□□□□ -0.371e-8■■■■■ 45.6
PCBP1Q15365 THRAP3-203ENST00000469141 3339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.271e-23■■■■■ 45.5
PCBP1Q15365 THRAP3-201ENST00000354618 4432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.561e-23■■■■■ 45.5
PCBP1Q15365 RER1-201ENST00000306256 695 ntTSL 522.77■■□□□ 1.243e-6■■■■■ 45.3
PCBP1Q15365 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.143e-6■■■■■ 45.3
PCBP1Q15365 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.623e-6■■■■■ 45.3
PCBP1Q15365 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 45.3
PCBP1Q15365 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 45.3
PCBP1Q15365 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 45.3
PCBP1Q15365 ATP11A-208ENST00000459908 4516 ntTSL 211.33□□□□□ -0.63e-7■■■■■ 45.3
PCBP1Q15365 RER1-205ENST00000443438 540 ntTSL 29.16□□□□□ -0.943e-6■■■■■ 45.3
PCBP1Q15365 ATP11A-204ENST00000418678 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)7.85□□□□□ -1.153e-7■■■■■ 45.3
PCBP1Q15365 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.786e-9■■■■■ 45.1
PCBP1Q15365 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.786e-9■■■■■ 45.1
PCBP1Q15365 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.616e-9■■■■■ 45.1
PCBP1Q15365 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.336e-9■■■■■ 45.1
PCBP1Q15365 DLGAP4-214ENST00000491207 469 ntTSL 415.81■□□□□ 0.126e-9■■■■■ 45.1
PCBP1Q15365 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.056e-9■■■■■ 45.1
PCBP1Q15365 DLGAP4-211ENST00000482037 603 ntTSL 514.58□□□□□ -0.086e-9■■■■■ 45.1
PCBP1Q15365 DLGAP4-212ENST00000482872 839 ntTSL 514.18□□□□□ -0.146e-9■■■■■ 45.1
PCBP1Q15365 DLGAP4-215ENST00000495241 794 ntTSL 212.34□□□□□ -0.436e-9■■■■■ 45.1
PCBP1Q15365 DLGAP4-203ENST00000373907 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.476e-9■■■■■ 45.1
PCBP1Q15365 MAPK1IP1L-202ENST00000553976 517 ntTSL 35.12□□□□□ -1.592e-7■■■■■ 44.9
PCBP1Q15365 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.47e-9■■■■■ 44.9
PCBP1Q15365 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.247e-9■■■■■ 44.9
PCBP1Q15365 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.967e-9■■■■■ 44.9
PCBP1Q15365 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.927e-9■■■■■ 44.9
PCBP1Q15365 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.897e-9■■■■■ 44.9
PCBP1Q15365 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.647e-9■■■■■ 44.9
PCBP1Q15365 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.157e-9■■■■■ 44.9
PCBP1Q15365 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.713e-9■■■■■ 44.7
PCBP1Q15365 DOT1L-204ENST00000457590 2907 ntTSL 515.56■□□□□ 0.084e-8■■■■■ 44.7
PCBP1Q15365 CHKB-205ENST00000468532 1052 ntTSL 534.51■■■■□ 3.121e-8■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.011e-8■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 CHKB-204ENST00000465842 428 ntTSL 220.93■□□□□ 0.941e-8■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.673e-16■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 LRP10-202ENST00000470660 486 ntTSL 317.3■□□□□ 0.361e-8■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.153e-16■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 TBC1D8-209ENST00000487392 373 ntTSL 515.24■□□□□ 0.033e-16■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.039e-9■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 MICU1-202ENST00000398761 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.242e-10■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.329e-9■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 P4HA1-201ENST00000263556 2844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.329e-9■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 TBC1D8-201ENST00000376840 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.333e-16■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 MICU1-212ENST00000642044 2221 ntBASIC12.91□□□□□ -0.342e-10■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 MICU1-211ENST00000635239 2215 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.342e-10■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 DAZAP2-203ENST00000436900 1811 ntTSL 512.38□□□□□ -0.431e-8■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 DAZAP2-215ENST00000604900 1045 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.431e-8■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 DAZAP2-205ENST00000449723 2098 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.451e-8■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 KLHDC4-205ENST00000446344 4444 ntBASIC12.17□□□□□ -0.466e-7■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 P4HA1-202ENST00000307116 2727 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.529e-9■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 P4HA1-203ENST00000373008 2727 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.529e-9■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 MICU1-201ENST00000361114 2383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.522e-10■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 DAZAP2-214ENST00000552459 3664 ntTSL 210.8□□□□□ -0.681e-8■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 GALNT2-202ENST00000485438 4030 ntTSL 510.69□□□□□ -0.73e-16■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 MICU1-205ENST00000476605 1933 ntTSL 210.68□□□□□ -0.72e-10■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 NCOR2-214ENST00000453428 674 ntTSL 510.44□□□□□ -0.743e-16■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 MICU1-204ENST00000418483 1212 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.932e-10■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 DAZAP2-202ENST00000425012 1117 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.051e-8■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.561e-8■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.368e-79■■■■■ 44.5
PCBP1Q15365 PXN-208ENST00000538144 1805 ntTSL 1 (best)16.35■□□□□ 0.212e-8■■■■■ 44.4
PCBP1Q15365 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.042e-8■■■■■ 44.4
PCBP1Q15365 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.124e-9■■■■■ 44.4
PCBP1Q15365 HIPK3-205ENST00000531504 591 ntTSL 222.12■■□□□ 1.132e-7■■■■■ 44.3
PCBP1Q15365 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 44.3
PCBP1Q15365 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 44.3
PCBP1Q15365 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 44.3
PCBP1Q15365 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 44.3
PCBP1Q15365 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.392e-7■■■■■ 44.3
PCBP1Q15365 TRAF3-201ENST00000347662 7700 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 44.3
PCBP1Q15365 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.692e-7■■■■■ 44.3
PCBP1Q15365 AC120057.3-201ENST00000570760 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.42e-12■■■■■ 44.3
PCBP1Q15365 TCEA2-205ENST00000415602 726 ntTSL 319.83■□□□□ 0.775e-13■■■■■ 44.2
PCBP1Q15365 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 44.2
PCBP1Q15365 CNDP2-202ENST00000324301 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.462e-7■■■■■ 44.2
PCBP1Q15365 CNDP2-209ENST00000579847 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 44.2
PCBP1Q15365 CNDP2-226ENST00000584581 4523 ntTSL 211.38□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 44.2
PCBP1Q15365 CNDP2-208ENST00000579624 1176 ntTSL 58.77□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 44.2
PCBP1Q15365 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.154e-13■■■■■ 44.1
PCBP1Q15365 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.024e-13■■■■■ 44.1
PCBP1Q15365 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.264e-13■■■■■ 44.1
PCBP1Q15365 RNASEK-C17orf49-202ENST00000547863 1662 ntTSL 225.83■■□□□ 1.734e-10■■■■■ 44.1
PCBP1Q15365 RNASEK-205ENST00000552176 1485 ntTSL 225.69■■□□□ 1.74e-10■■■■■ 44.1
PCBP1Q15365 RNASEK-C17orf49-204ENST00000607564 892 ntTSL 524.83■■□□□ 1.574e-10■■■■■ 44.1
PCBP1Q15365 RNASEK-C17orf49-203ENST00000549775 1856 ntTSL 523.02■■□□□ 1.284e-10■■■■■ 44.1
PCBP1Q15365 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.054e-10■■■■■ 44.1
PCBP1Q15365 RNASEK-201ENST00000546395 952 ntTSL 1 (best)18.87■□□□□ 0.614e-10■■■■■ 44.1
PCBP1Q15365 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.564e-10■■■■■ 44.1
PCBP1Q15365 RNASEK-206ENST00000552321 739 ntTSL 218.23■□□□□ 0.514e-10■■■■■ 44.1
PCBP1Q15365 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.514e-10■■■■■ 44.1
PCBP1Q15365 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.384e-10■■■■■ 44.1
PCBP1Q15365 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.034e-10■■■■■ 44.1
PCBP1Q15365 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.034e-10■■■■■ 44.1
PCBP1Q15365 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.245e-7■■■■■ 43.8
PCBP1Q15365 BAZ2A-210ENST00000549787 2773 ntTSL 1 (best)12.65□□□□□ -0.383e-12■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 31e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.851e-7■■■■■ 43.7
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