RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495241.5

DLGAP4-215, Transcript of DLG associated protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene DLGAP4, Length 794 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLGAP4-215ENST00000495241 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.62■■■□□ 2.01
DLGAP4-215ENST00000495241 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.69■■□□□ 1.54
DLGAP4-215ENST00000495241 ABCC9O60706 1549 aa24.22■■□□□ 1.47
DLGAP4-215ENST00000495241 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.23■■□□□ 1.31
DLGAP4-215ENST00000495241 NACADO15069 1562 aa23.14■■□□□ 1.29
DLGAP4-215ENST00000495241 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
DLGAP4-215ENST00000495241 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.01■■□□□ 1.27
DLGAP4-215ENST00000495241 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.92■■□□□ 1.26
DLGAP4-215ENST00000495241 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.92■■□□□ 1.26
DLGAP4-215ENST00000495241 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.8■■□□□ 1.24
DLGAP4-215ENST00000495241 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.6■■□□□ 1.21
DLGAP4-215ENST00000495241 SCRIBQ14160 1630 aa22.55■■□□□ 1.2
DLGAP4-215ENST00000495241 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
DLGAP4-215ENST00000495241 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.29■■□□□ 1.16
DLGAP4-215ENST00000495241 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.21■■□□□ 1.15
DLGAP4-215ENST00000495241 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
DLGAP4-215ENST00000495241 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.95■■□□□ 1.1
DLGAP4-215ENST00000495241 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.72■■□□□ 1.07
DLGAP4-215ENST00000495241 SMARCA4P51532 1647 aa21.52■■□□□ 1.04
DLGAP4-215ENST00000495241 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
DLGAP4-215ENST00000495241 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.35■■□□□ 1.01
DLGAP4-215ENST00000495241 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.32■■□□□ 1
DLGAP4-215ENST00000495241 SMARCA2P51531 1590 aa21.31■■□□□ 1
DLGAP4-215ENST00000495241 NCAPD3P42695 1498 aa21.31■■□□□ 1
DLGAP4-215ENST00000495241 HMGXB3Q12766 1538 aa21.28■■□□□ 1
DLGAP4-215ENST00000495241 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.27■□□□□ 0.99
DLGAP4-215ENST00000495241 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
DLGAP4-215ENST00000495241 WIZO95785 1651 aa21.16■□□□□ 0.98
DLGAP4-215ENST00000495241 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
DLGAP4-215ENST00000495241 NESP48681 1621 aa20.96■□□□□ 0.95
DLGAP4-215ENST00000495241 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
DLGAP4-215ENST00000495241 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.84■□□□□ 0.93
DLGAP4-215ENST00000495241 ERCC6Q03468 1493 aa20.83■□□□□ 0.93
DLGAP4-215ENST00000495241 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.81■□□□□ 0.92
DLGAP4-215ENST00000495241 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
DLGAP4-215ENST00000495241 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.66■□□□□ 0.9
DLGAP4-215ENST00000495241 CUX2O14529 1486 aa20.64■□□□□ 0.89
DLGAP4-215ENST00000495241 PRDM2Q13029 1718 aa20.61■□□□□ 0.89
DLGAP4-215ENST00000495241 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.6■□□□□ 0.89
DLGAP4-215ENST00000495241 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.56■□□□□ 0.88
DLGAP4-215ENST00000495241 CFTRP13569 1480 aa20.56■□□□□ 0.88
DLGAP4-215ENST00000495241 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.5■□□□□ 0.87
DLGAP4-215ENST00000495241 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.49■□□□□ 0.87
DLGAP4-215ENST00000495241 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.48■□□□□ 0.87
DLGAP4-215ENST00000495241 WDR62O43379 1518 aa20.46■□□□□ 0.87
DLGAP4-215ENST00000495241 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
DLGAP4-215ENST00000495241 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
DLGAP4-215ENST00000495241 TOPBP1Q92547 1522 aa20.18■□□□□ 0.82
DLGAP4-215ENST00000495241 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.17■□□□□ 0.82
DLGAP4-215ENST00000495241 ABCC8Q09428 1581 aa20.06■□□□□ 0.8
DLGAP4-215ENST00000495241 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.06■□□□□ 0.8
DLGAP4-215ENST00000495241 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
DLGAP4-215ENST00000495241 CUX1P39880 1505 aa20.02■□□□□ 0.8
DLGAP4-215ENST00000495241 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
DLGAP4-215ENST00000495241 IFT140Q96RY7 1462 aa20.02■□□□□ 0.8
DLGAP4-215ENST00000495241 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
DLGAP4-215ENST00000495241 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
DLGAP4-215ENST00000495241 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.95■□□□□ 0.78
DLGAP4-215ENST00000495241 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.92■□□□□ 0.78
DLGAP4-215ENST00000495241 WDR97A6NE52 1622 aa19.91■□□□□ 0.78
DLGAP4-215ENST00000495241 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.86■□□□□ 0.77
DLGAP4-215ENST00000495241 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.86■□□□□ 0.771e-7■■■■■ 50.4
DLGAP4-215ENST00000495241 SYNJ1O43426 1573 aa19.85■□□□□ 0.77
DLGAP4-215ENST00000495241 CHD1O14646 1710 aa19.84■□□□□ 0.77
DLGAP4-215ENST00000495241 SOGA1O94964 1423 aa19.84■□□□□ 0.77
DLGAP4-215ENST00000495241 TOP2BQ02880 1626 aa19.81■□□□□ 0.76
DLGAP4-215ENST00000495241 PBRM1Q86U86 1689 aa19.79■□□□□ 0.76
DLGAP4-215ENST00000495241 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
DLGAP4-215ENST00000495241 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.76■□□□□ 0.75
DLGAP4-215ENST00000495241 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.74■□□□□ 0.75
DLGAP4-215ENST00000495241 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.71■□□□□ 0.75
DLGAP4-215ENST00000495241 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.7■□□□□ 0.74
DLGAP4-215ENST00000495241 OSCARQ8IYS5 282 aa19.66■□□□□ 0.74
DLGAP4-215ENST00000495241 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.65■□□□□ 0.74
DLGAP4-215ENST00000495241 GRIN2BQ13224 1484 aa19.64■□□□□ 0.73
DLGAP4-215ENST00000495241 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
DLGAP4-215ENST00000495241 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa19.58■□□□□ 0.73
DLGAP4-215ENST00000495241 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa19.58■□□□□ 0.73
DLGAP4-215ENST00000495241 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa19.58■□□□□ 0.73
DLGAP4-215ENST00000495241 FBLN2P98095 1184 aa19.56■□□□□ 0.72
DLGAP4-215ENST00000495241 ADAMTS12P58397 1594 aa19.56■□□□□ 0.72
DLGAP4-215ENST00000495241 SYNJ2O15056 1496 aa19.54■□□□□ 0.72
DLGAP4-215ENST00000495241 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.52■□□□□ 0.72
DLGAP4-215ENST00000495241 ARHGEF11O15085 1522 aa19.51■□□□□ 0.71
DLGAP4-215ENST00000495241 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.47■□□□□ 0.71
DLGAP4-215ENST00000495241 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
DLGAP4-215ENST00000495241 GRIN2AQ12879 1464 aa19.43■□□□□ 0.7
DLGAP4-215ENST00000495241 CEP170Q5SW79 1584 aa19.42■□□□□ 0.7
DLGAP4-215ENST00000495241 TRIM41Q8WV44 630 aa19.42■□□□□ 0.7
DLGAP4-215ENST00000495241 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.38■□□□□ 0.69
DLGAP4-215ENST00000495241 ARAP1Q96P48 1450 aa19.35■□□□□ 0.69
DLGAP4-215ENST00000495241 CUL7Q14999 1698 aa19.33■□□□□ 0.69
DLGAP4-215ENST00000495241 NUP160Q12769 1436 aa19.33■□□□□ 0.68
DLGAP4-215ENST00000495241 KIF27Q86VH2 1401 aa19.32■□□□□ 0.68
DLGAP4-215ENST00000495241 SHROOM2Q13796 1616 aa19.29■□□□□ 0.68
DLGAP4-215ENST00000495241 ERCC6L2Q5T890 1561 aa19.29■□□□□ 0.68
DLGAP4-215ENST00000495241 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.28■□□□□ 0.68
DLGAP4-215ENST00000495241 IGF1RP08069 1367 aa19.25■□□□□ 0.67
DLGAP4-215ENST00000495241 CYB5RLQ6IPT4 315 aa19.21■□□□□ 0.67
DLGAP4-215ENST00000495241 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.6 ms