Protein–RNA interactions for Protein: Q12242

RUP1, UBA domain-containing protein RUP1, yeastyeast

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RUP1Q12242 TPO1YLL028W 1761 nt7.69□□□□□ -1.18
RUP1Q12242 ATO2YNR002C 849 nt7.69□□□□□ -1.18
RUP1Q12242 MAL31YBR298C 1845 nt7.68□□□□□ -1.18
RUP1Q12242 RPL12BYDR418W 498 nt7.68□□□□□ -1.18
RUP1Q12242 CHS7YHR142W 951 nt7.68□□□□□ -1.18
RUP1Q12242 YIA6YIL006W 1122 nt7.68□□□□□ -1.18
RUP1Q12242 TES1YJR019C 1050 nt7.68□□□□□ -1.18
RUP1Q12242 YKR018CYKR018C 2178 nt7.68□□□□□ -1.18
RUP1Q12242 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.67□□□□□ -1.18
RUP1Q12242 GNA1YFL017C 480 nt7.67□□□□□ -1.18
RUP1Q12242 CDA1YLR307W 906 nt7.67□□□□□ -1.18
RUP1Q12242 ELP6YMR312W 822 nt7.67□□□□□ -1.18
RUP1Q12242 FCY1YPR062W 477 nt7.67□□□□□ -1.18
RUP1Q12242 YER137CYER137C 447 nt7.66□□□□□ -1.18
RUP1Q12242 RNA170RNA170 169 nt7.66□□□□□ -1.18
RUP1Q12242 MET22YOL064C 1074 nt7.66□□□□□ -1.18
RUP1Q12242 AFG2YLR397C 2343 nt7.66□□□□□ -1.18
RUP1Q12242 RCR1YBR005W 642 nt7.65□□□□□ -1.18
RUP1Q12242 PRB1YEL060C 1908 nt7.64□□□□□ -1.19
RUP1Q12242 OCH1YGL038C 1443 nt7.64□□□□□ -1.19
RUP1Q12242 RIB1YBL033C 1038 nt7.64□□□□□ -1.19
RUP1Q12242 LSP1YPL004C 1026 nt7.64□□□□□ -1.19
RUP1Q12242 CAK1YFL029C 1107 nt7.63□□□□□ -1.19
RUP1Q12242 OLA1YBR025C 1185 nt7.63□□□□□ -1.19
RUP1Q12242 PDC6YGR087C 1692 nt7.63□□□□□ -1.19
RUP1Q12242 MAS2YHR024C 1449 nt7.62□□□□□ -1.19
RUP1Q12242 SEC24YIL109C 2781 nt7.62□□□□□ -1.19
RUP1Q12242 BNA3YJL060W 1335 nt7.62□□□□□ -1.19
RUP1Q12242 YJL160CYJL160C 864 nt7.62□□□□□ -1.19
RUP1Q12242 YOR041CYOR041C 432 nt7.62□□□□□ -1.19
RUP1Q12242 YIL108WYIL108W 2091 nt7.62□□□□□ -1.19
RUP1Q12242 NDE1YMR145C 1683 nt7.61□□□□□ -1.19
RUP1Q12242 SOD2YHR008C 702 nt7.61□□□□□ -1.19
RUP1Q12242 RRT14YIL127C 621 nt7.61□□□□□ -1.19
RUP1Q12242 MTC6YHR151C 1581 nt7.61□□□□□ -1.19
RUP1Q12242 SNA3YJL151C 402 nt7.6□□□□□ -1.19
RUP1Q12242 YBL113CYBL113C 2379 nt7.6□□□□□ -1.19
RUP1Q12242 YNL040WYNL040W 1371 nt7.59□□□□□ -1.19
RUP1Q12242 TOD6YBL054W 1578 nt7.59□□□□□ -1.19
RUP1Q12242 SNP1YIL061C 903 nt7.59□□□□□ -1.19
RUP1Q12242 CDC23YHR166C 1881 nt7.58□□□□□ -1.2
RUP1Q12242 PET18YCR020C 648 nt7.57□□□□□ -1.2
RUP1Q12242 RCF2YNR018W 675 nt7.57□□□□□ -1.2
RUP1Q12242 PUP3YER094C 618 nt7.56□□□□□ -1.2
RUP1Q12242 GTS1YGL181W 1191 nt7.56□□□□□ -1.2
RUP1Q12242 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.56□□□□□ -1.2
RUP1Q12242 LEO1YOR123C 1395 nt7.56□□□□□ -1.2
RUP1Q12242 HXT8YJL214W 1710 nt7.55□□□□□ -1.2
RUP1Q12242 DCR2YLR361C 1737 nt7.55□□□□□ -1.2
RUP1Q12242 GNP1YDR508C 1992 nt7.55□□□□□ -1.2
RUP1Q12242 RMD8YFR048W 1989 nt7.55□□□□□ -1.2
RUP1Q12242 YER156CYER156C 1017 nt7.55□□□□□ -1.2
RUP1Q12242 SNF7YLR025W 723 nt7.55□□□□□ -1.2
RUP1Q12242 TCB1YOR086C 3561 nt7.54□□□□□ -1.2
RUP1Q12242 RHO1YPR165W 630 nt7.54□□□□□ -1.2
RUP1Q12242 PUS7YOR243C 2031 nt7.54□□□□□ -1.2
RUP1Q12242 YJL043WYJL043W 774 nt7.53□□□□□ -1.2
RUP1Q12242 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.52□□□□□ -1.2
RUP1Q12242 HXT13YEL069C 1695 nt7.52□□□□□ -1.21
RUP1Q12242 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.52□□□□□ -1.21
RUP1Q12242 YBL111CYBL111C 2004 nt7.51□□□□□ -1.21
RUP1Q12242 FLC2YAL053W 2352 nt7.51□□□□□ -1.21
RUP1Q12242 YPT31YER031C 672 nt7.51□□□□□ -1.21
RUP1Q12242 APT1YML022W 564 nt7.51□□□□□ -1.21
RUP1Q12242 NSG2YNL156C 900 nt7.51□□□□□ -1.21
RUP1Q12242 CAN1YEL063C 1773 nt7.51□□□□□ -1.21
RUP1Q12242 BXI1YNL305C 894 nt7.5□□□□□ -1.21
RUP1Q12242 AOS1YPR180W 1044 nt7.5□□□□□ -1.21
RUP1Q12242 FCP1YMR277W 2199 nt7.49□□□□□ -1.21
RUP1Q12242 SHC1YER096W 1539 nt7.49□□□□□ -1.21
RUP1Q12242 TPI1YDR050C 747 nt7.49□□□□□ -1.21
RUP1Q12242 PET10YKR046C 852 nt7.49□□□□□ -1.21
RUP1Q12242 MFT1YML062C 1179 nt7.49□□□□□ -1.21
RUP1Q12242 RPS6AYPL090C 711 nt7.49□□□□□ -1.21
RUP1Q12242 RFS1YBR052C 633 nt7.49□□□□□ -1.21
RUP1Q12242 RPS6BYBR181C 711 nt7.49□□□□□ -1.21
RUP1Q12242 THI73YLR004C 1572 nt7.49□□□□□ -1.21
RUP1Q12242 YPR084WYPR084W 1371 nt7.48□□□□□ -1.21
RUP1Q12242 YLR173WYLR173W 1827 nt7.48□□□□□ -1.21
RUP1Q12242 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.48□□□□□ -1.21
RUP1Q12242 HAM1YJR069C 594 nt7.47□□□□□ -1.21
RUP1Q12242 RTC2YBR147W 891 nt7.47□□□□□ -1.21
RUP1Q12242 ENB1YOL158C 1821 nt7.47□□□□□ -1.21
RUP1Q12242 HNM1YGL077C 1692 nt7.47□□□□□ -1.21
RUP1Q12242 UTR5YEL035C 501 nt7.46□□□□□ -1.22
RUP1Q12242 YMR206WYMR206W 942 nt7.46□□□□□ -1.22
RUP1Q12242 RTG2YGL252C 1767 nt7.46□□□□□ -1.22
RUP1Q12242 GRH1YDR517W 1119 nt7.45□□□□□ -1.22
RUP1Q12242 HRA1HRA1 564 nt7.45□□□□□ -1.22
RUP1Q12242 VPS65YLR322W 315 nt7.45□□□□□ -1.22
RUP1Q12242 ATP2YJR121W 1536 nt7.45□□□□□ -1.22
RUP1Q12242 ADA2YDR448W 1305 nt7.45□□□□□ -1.22
RUP1Q12242 MSS51YLR203C 1311 nt7.45□□□□□ -1.22
RUP1Q12242 CKI1YLR133W 1749 nt7.44□□□□□ -1.22
RUP1Q12242 YHR033WYHR033W 1272 nt7.44□□□□□ -1.22
RUP1Q12242 PRE10YOR362C 867 nt7.44□□□□□ -1.22
RUP1Q12242 PPS1YBR276C 2424 nt7.44□□□□□ -1.22
RUP1Q12242 ECM10YEL030W 1935 nt7.44□□□□□ -1.22
RUP1Q12242 PMU1YKL128C 888 nt7.43□□□□□ -1.22
RUP1Q12242 TIM50YPL063W 1431 nt7.43□□□□□ -1.22
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