Protein–RNA interactions for Protein: Q03785

VHS1, Serine/threonine-protein kinase VHS1, yeastyeast

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1Q03785 UTR5YEL035C 501 nt7.57□□□□□ -1.2
VHS1Q03785 RCF1YML030W 480 nt7.57□□□□□ -1.2
VHS1Q03785 PFS2YNL317W 1398 nt7.57□□□□□ -1.2
VHS1Q03785 FTH1YBR207W 1398 nt7.57□□□□□ -1.2
VHS1Q03785 YER156CYER156C 1017 nt7.56□□□□□ -1.2
VHS1Q03785 PRE5YMR314W 705 nt7.56□□□□□ -1.2
VHS1Q03785 YNL140CYNL140C 570 nt7.56□□□□□ -1.2
VHS1Q03785 PRE10YOR362C 867 nt7.56□□□□□ -1.2
VHS1Q03785 ELP4YPL101W 1371 nt7.56□□□□□ -1.2
VHS1Q03785 YPL247CYPL247C 1572 nt7.55□□□□□ -1.2
VHS1Q03785 TDA4YJR116W 840 nt7.55□□□□□ -1.2
VHS1Q03785 DIA4YHR011W 1341 nt7.54□□□□□ -1.2
VHS1Q03785 TGL5YOR081C 2250 nt7.54□□□□□ -1.2
VHS1Q03785 WSC3YOL105C 1671 nt7.54□□□□□ -1.2
VHS1Q03785 INM1YHR046C 888 nt7.54□□□□□ -1.2
VHS1Q03785 TIF3YPR163C 1311 nt7.53□□□□□ -1.2
VHS1Q03785 HXT8YJL214W 1710 nt7.53□□□□□ -1.2
VHS1Q03785 MRP7YNL005C 1116 nt7.53□□□□□ -1.2
VHS1Q03785 SDH8YBR269C 417 nt7.53□□□□□ -1.2
VHS1Q03785 HSV2YGR223C 1347 nt7.52□□□□□ -1.2
VHS1Q03785 GLY1YEL046C 1164 nt7.52□□□□□ -1.21
VHS1Q03785 ADE1YAR015W 921 nt7.52□□□□□ -1.21
VHS1Q03785 FUS3YBL016W 1062 nt7.52□□□□□ -1.21
VHS1Q03785 NDE1YMR145C 1683 nt7.51□□□□□ -1.21
VHS1Q03785 JHD1YER051W 1479 nt7.51□□□□□ -1.21
VHS1Q03785 PMU1YKL128C 888 nt7.51□□□□□ -1.21
VHS1Q03785 DIP5YPL265W 1827 nt7.5□□□□□ -1.21
VHS1Q03785 AIM34YMR003W 597 nt7.5□□□□□ -1.21
VHS1Q03785 ATP2YJR121W 1536 nt7.5□□□□□ -1.21
VHS1Q03785 TIM50YPL063W 1431 nt7.5□□□□□ -1.21
VHS1Q03785 MRN1YPL184C 1839 nt7.5□□□□□ -1.21
VHS1Q03785 GGC1YDL198C 903 nt7.49□□□□□ -1.21
VHS1Q03785 YIL168WYIL168W 384 nt7.49□□□□□ -1.21
VHS1Q03785 MDH2YOL126C 1134 nt7.49□□□□□ -1.21
VHS1Q03785 SLM3YDL033C 1254 nt7.48□□□□□ -1.21
VHS1Q03785 ARO3YDR035W 1113 nt7.48□□□□□ -1.21
VHS1Q03785 SNP1YIL061C 903 nt7.48□□□□□ -1.21
VHS1Q03785 MNN9YPL050C 1188 nt7.48□□□□□ -1.21
VHS1Q03785 YJL043WYJL043W 774 nt7.47□□□□□ -1.21
VHS1Q03785 TDH1YJL052W 999 nt7.47□□□□□ -1.21
VHS1Q03785 PET494YNR045W 1470 nt7.47□□□□□ -1.21
VHS1Q03785 ARG7YMR062C 1326 nt7.45□□□□□ -1.22
VHS1Q03785 ALG7YBR243C 1347 nt7.45□□□□□ -1.22
VHS1Q03785 BEM1YBR200W 1656 nt7.44□□□□□ -1.22
VHS1Q03785 NUP53YMR153W 1428 nt7.44□□□□□ -1.22
VHS1Q03785 CTF3YLR381W 2202 nt7.44□□□□□ -1.22
VHS1Q03785 TOP3YLR234W 1971 nt7.44□□□□□ -1.22
VHS1Q03785 KTR4YBR199W 1395 nt7.44□□□□□ -1.22
VHS1Q03785 WSC4YHL028W 1818 nt7.43□□□□□ -1.22
VHS1Q03785 AFG2YLR397C 2343 nt7.43□□□□□ -1.22
VHS1Q03785 ITR1YDR497C 1755 nt7.42□□□□□ -1.22
VHS1Q03785 MTC6YHR151C 1581 nt7.42□□□□□ -1.22
VHS1Q03785 CCR4YAL021C 2514 nt7.41□□□□□ -1.22
VHS1Q03785 MAM3YOL060C 2121 nt7.4□□□□□ -1.23
VHS1Q03785 RPR1RPR1 369 nt7.37□□□□□ -1.23
VHS1Q03785 ADE2YOR128C 1716 nt7.37□□□□□ -1.23
VHS1Q03785 YIL108WYIL108W 2091 nt7.37□□□□□ -1.23
VHS1Q03785 CHA1YCL064C 1083 nt7.36□□□□□ -1.23
VHS1Q03785 DST1YGL043W 930 nt7.36□□□□□ -1.23
VHS1Q03785 ATP10YLR393W 840 nt7.36□□□□□ -1.23
VHS1Q03785 APT1YML022W 564 nt7.36□□□□□ -1.23
VHS1Q03785 ELP6YMR312W 822 nt7.36□□□□□ -1.23
VHS1Q03785 PMT7YDR307W 1989 nt7.35□□□□□ -1.23
VHS1Q03785 PRC1YMR297W 1599 nt7.35□□□□□ -1.23
VHS1Q03785 PSP2YML017W 1782 nt7.34□□□□□ -1.23
VHS1Q03785 TES1YJR019C 1050 nt7.34□□□□□ -1.23
VHS1Q03785 HAM1YJR069C 594 nt7.34□□□□□ -1.23
VHS1Q03785 AOS1YPR180W 1044 nt7.34□□□□□ -1.23
VHS1Q03785 SPR1YOR190W 1338 nt7.33□□□□□ -1.24
VHS1Q03785 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.33□□□□□ -1.24
VHS1Q03785 SPE4YLR146C 903 nt7.33□□□□□ -1.24
VHS1Q03785 COS10YNR075W 1125 nt7.33□□□□□ -1.24
VHS1Q03785 YPL264CYPL264C 1062 nt7.33□□□□□ -1.24
VHS1Q03785 PNS1YOR161C 1620 nt7.32□□□□□ -1.24
VHS1Q03785 YDR476CYDR476C 675 nt7.32□□□□□ -1.24
VHS1Q03785 CDA1YLR307W 906 nt7.32□□□□□ -1.24
VHS1Q03785 SNU66YOR308C 1764 nt7.31□□□□□ -1.24
VHS1Q03785 HAC1YFL031W 717 nt7.31□□□□□ -1.24
VHS1Q03785 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.3□□□□□ -1.24
VHS1Q03785 YML034C-AYML034C-A 399 nt7.3□□□□□ -1.24
VHS1Q03785 AVL9YLR114C 2295 nt7.3□□□□□ -1.24
VHS1Q03785 CPR2YHR057C 618 nt7.29□□□□□ -1.24
VHS1Q03785 CPT1YNL130C 1182 nt7.29□□□□□ -1.24
VHS1Q03785 CKB1YGL019W 837 nt7.28□□□□□ -1.24
VHS1Q03785 RRT6YGL146C 936 nt7.28□□□□□ -1.24
VHS1Q03785 ATO2YNR002C 849 nt7.28□□□□□ -1.24
VHS1Q03785 YHR033WYHR033W 1272 nt7.27□□□□□ -1.25
VHS1Q03785 STE3YKL178C 1413 nt7.27□□□□□ -1.25
VHS1Q03785 PUP2YGR253C 783 nt7.26□□□□□ -1.25
VHS1Q03785 ERR3YMR323W 1314 nt7.26□□□□□ -1.25
VHS1Q03785 ERR1YOR393W 1314 nt7.26□□□□□ -1.25
VHS1Q03785 ERR2YPL281C 1314 nt7.26□□□□□ -1.25
VHS1Q03785 TPO1YLL028W 1761 nt7.25□□□□□ -1.25
VHS1Q03785 YNL295WYNL295W 1575 nt7.25□□□□□ -1.25
VHS1Q03785 RRP43YCR035C 1185 nt7.24□□□□□ -1.25
VHS1Q03785 YLR358CYLR358C 564 nt7.24□□□□□ -1.25
VHS1Q03785 INP54YOL065C 1155 nt7.24□□□□□ -1.25
VHS1Q03785 HXT13YEL069C 1695 nt7.24□□□□□ -1.25
VHS1Q03785 MAS2YHR024C 1449 nt7.24□□□□□ -1.25
VHS1Q03785 HXT9YJL219W 1704 nt7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 59.3 ms