Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PHC1P78364 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHC1P78364 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PHC1P78364 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHC1P78364 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHC1P78364 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHC1P78364 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHC1P78364 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHC1P78364 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHC1P78364 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHC1P78364 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHC1P78364 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHC1P78364 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PHC1P78364 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHC1P78364 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHC1P78364 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PHC1P78364 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHC1P78364 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHC1P78364 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHC1P78364 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PHC1P78364 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHC1P78364 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHC1P78364 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHC1P78364 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHC1P78364 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PHC1P78364 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHC1P78364 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHC1P78364 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHC1P78364 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHC1P78364 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHC1P78364 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHC1P78364 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHC1P78364 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHC1P78364 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PHC1P78364 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PHC1P78364 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PHC1P78364 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHC1P78364 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHC1P78364 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHC1P78364 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHC1P78364 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHC1P78364 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHC1P78364 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHC1P78364 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHC1P78364 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHC1P78364 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHC1P78364 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHC1P78364 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHC1P78364 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHC1P78364 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHC1P78364 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHC1P78364 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHC1P78364 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHC1P78364 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHC1P78364 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHC1P78364 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHC1P78364 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHC1P78364 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHC1P78364 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHC1P78364 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHC1P78364 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHC1P78364 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHC1P78364 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHC1P78364 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHC1P78364 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PHC1P78364 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PHC1P78364 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHC1P78364 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHC1P78364 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PHC1P78364 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHC1P78364 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHC1P78364 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHC1P78364 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHC1P78364 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHC1P78364 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHC1P78364 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHC1P78364 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHC1P78364 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHC1P78364 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHC1P78364 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHC1P78364 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHC1P78364 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PHC1P78364 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHC1P78364 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PHC1P78364 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHC1P78364 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHC1P78364 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHC1P78364 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHC1P78364 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PHC1P78364 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PHC1P78364 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHC1P78364 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHC1P78364 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHC1P78364 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PHC1P78364 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHC1P78364 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHC1P78364 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHC1P78364 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHC1P78364 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHC1P78364 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms