Protein–RNA interactions for Protein: P63173

RPL38, 60S ribosomal protein L38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL38P63173 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL38P63173 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL38P63173 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL38P63173 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL38P63173 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPL38P63173 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPL38P63173 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL38P63173 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL38P63173 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL38P63173 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL38P63173 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL38P63173 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL38P63173 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL38P63173 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL38P63173 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL38P63173 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL38P63173 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL38P63173 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL38P63173 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL38P63173 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL38P63173 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL38P63173 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL38P63173 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL38P63173 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL38P63173 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL38P63173 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL38P63173 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL38P63173 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL38P63173 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL38P63173 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL38P63173 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL38P63173 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL38P63173 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL38P63173 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL38P63173 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL38P63173 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL38P63173 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL38P63173 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL38P63173 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL38P63173 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL38P63173 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL38P63173 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL38P63173 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL38P63173 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL38P63173 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL38P63173 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL38P63173 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL38P63173 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL38P63173 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL38P63173 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL38P63173 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL38P63173 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL38P63173 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL38P63173 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL38P63173 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL38P63173 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL38P63173 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL38P63173 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL38P63173 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL38P63173 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL38P63173 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL38P63173 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL38P63173 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL38P63173 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL38P63173 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL38P63173 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL38P63173 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL38P63173 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL38P63173 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL38P63173 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL38P63173 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL38P63173 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL38P63173 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL38P63173 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL38P63173 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL38P63173 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL38P63173 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL38P63173 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL38P63173 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL38P63173 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL38P63173 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL38P63173 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL38P63173 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL38P63173 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL38P63173 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL38P63173 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL38P63173 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL38P63173 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL38P63173 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL38P63173 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL38P63173 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL38P63173 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL38P63173 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL38P63173 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL38P63173 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL38P63173 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL38P63173 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL38P63173 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL38P63173 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL38P63173 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms