Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UFM1P61960 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UFM1P61960 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UFM1P61960 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UFM1P61960 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UFM1P61960 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UFM1P61960 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UFM1P61960 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UFM1P61960 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UFM1P61960 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UFM1P61960 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UFM1P61960 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UFM1P61960 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UFM1P61960 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UFM1P61960 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UFM1P61960 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UFM1P61960 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UFM1P61960 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UFM1P61960 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UFM1P61960 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UFM1P61960 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UFM1P61960 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UFM1P61960 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UFM1P61960 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UFM1P61960 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UFM1P61960 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UFM1P61960 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UFM1P61960 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UFM1P61960 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UFM1P61960 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UFM1P61960 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UFM1P61960 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UFM1P61960 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UFM1P61960 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UFM1P61960 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UFM1P61960 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UFM1P61960 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UFM1P61960 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UFM1P61960 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UFM1P61960 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UFM1P61960 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UFM1P61960 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UFM1P61960 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UFM1P61960 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UFM1P61960 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UFM1P61960 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UFM1P61960 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UFM1P61960 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UFM1P61960 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UFM1P61960 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UFM1P61960 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UFM1P61960 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UFM1P61960 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UFM1P61960 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UFM1P61960 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UFM1P61960 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UFM1P61960 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UFM1P61960 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UFM1P61960 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UFM1P61960 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UFM1P61960 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UFM1P61960 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UFM1P61960 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UFM1P61960 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UFM1P61960 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UFM1P61960 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UFM1P61960 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UFM1P61960 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UFM1P61960 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UFM1P61960 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UFM1P61960 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UFM1P61960 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UFM1P61960 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UFM1P61960 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UFM1P61960 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UFM1P61960 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UFM1P61960 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
UFM1P61960 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UFM1P61960 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UFM1P61960 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UFM1P61960 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UFM1P61960 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UFM1P61960 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UFM1P61960 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UFM1P61960 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UFM1P61960 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UFM1P61960 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UFM1P61960 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UFM1P61960 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UFM1P61960 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UFM1P61960 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UFM1P61960 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UFM1P61960 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UFM1P61960 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UFM1P61960 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UFM1P61960 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UFM1P61960 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UFM1P61960 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UFM1P61960 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UFM1P61960 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms