Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERFP50548 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERFP50548 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERFP50548 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERFP50548 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ERFP50548 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ERFP50548 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERFP50548 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERFP50548 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ERFP50548 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERFP50548 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERFP50548 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ERFP50548 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERFP50548 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERFP50548 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERFP50548 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERFP50548 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERFP50548 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERFP50548 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERFP50548 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERFP50548 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERFP50548 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERFP50548 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERFP50548 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERFP50548 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERFP50548 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ERFP50548 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERFP50548 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERFP50548 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERFP50548 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERFP50548 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERFP50548 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERFP50548 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERFP50548 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERFP50548 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERFP50548 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERFP50548 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERFP50548 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERFP50548 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERFP50548 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERFP50548 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERFP50548 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERFP50548 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERFP50548 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERFP50548 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERFP50548 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERFP50548 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERFP50548 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERFP50548 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERFP50548 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERFP50548 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERFP50548 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERFP50548 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERFP50548 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERFP50548 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERFP50548 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERFP50548 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERFP50548 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERFP50548 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERFP50548 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERFP50548 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERFP50548 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERFP50548 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERFP50548 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERFP50548 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERFP50548 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERFP50548 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERFP50548 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERFP50548 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERFP50548 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERFP50548 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERFP50548 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERFP50548 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERFP50548 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERFP50548 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERFP50548 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ERFP50548 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERFP50548 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERFP50548 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ERFP50548 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ERFP50548 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERFP50548 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERFP50548 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERFP50548 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERFP50548 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERFP50548 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERFP50548 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERFP50548 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERFP50548 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERFP50548 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERFP50548 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERFP50548 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERFP50548 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERFP50548 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERFP50548 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERFP50548 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERFP50548 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERFP50548 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERFP50548 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERFP50548 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms