Protein–RNA interactions for Protein: P49006

MARCKSL1, MARCKS-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSL1P49006 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MARCKSL1P49006 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MARCKSL1P49006 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MARCKSL1P49006 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARCKSL1P49006 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARCKSL1P49006 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARCKSL1P49006 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MARCKSL1P49006 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MARCKSL1P49006 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MARCKSL1P49006 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MARCKSL1P49006 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MARCKSL1P49006 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MARCKSL1P49006 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MARCKSL1P49006 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MARCKSL1P49006 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MARCKSL1P49006 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MARCKSL1P49006 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MARCKSL1P49006 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MARCKSL1P49006 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MARCKSL1P49006 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MARCKSL1P49006 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MARCKSL1P49006 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MARCKSL1P49006 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MARCKSL1P49006 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MARCKSL1P49006 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MARCKSL1P49006 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MARCKSL1P49006 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MARCKSL1P49006 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MARCKSL1P49006 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MARCKSL1P49006 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MARCKSL1P49006 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MARCKSL1P49006 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MARCKSL1P49006 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MARCKSL1P49006 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MARCKSL1P49006 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MARCKSL1P49006 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MARCKSL1P49006 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MARCKSL1P49006 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MARCKSL1P49006 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MARCKSL1P49006 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MARCKSL1P49006 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MARCKSL1P49006 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MARCKSL1P49006 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MARCKSL1P49006 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARCKSL1P49006 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARCKSL1P49006 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARCKSL1P49006 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARCKSL1P49006 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARCKSL1P49006 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MARCKSL1P49006 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARCKSL1P49006 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARCKSL1P49006 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARCKSL1P49006 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARCKSL1P49006 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MARCKSL1P49006 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MARCKSL1P49006 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MARCKSL1P49006 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MARCKSL1P49006 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MARCKSL1P49006 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MARCKSL1P49006 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MARCKSL1P49006 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MARCKSL1P49006 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MARCKSL1P49006 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MARCKSL1P49006 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MARCKSL1P49006 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MARCKSL1P49006 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MARCKSL1P49006 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MARCKSL1P49006 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MARCKSL1P49006 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MARCKSL1P49006 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MARCKSL1P49006 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MARCKSL1P49006 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MARCKSL1P49006 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MARCKSL1P49006 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARCKSL1P49006 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARCKSL1P49006 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARCKSL1P49006 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARCKSL1P49006 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARCKSL1P49006 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MARCKSL1P49006 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MARCKSL1P49006 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MARCKSL1P49006 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MARCKSL1P49006 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MARCKSL1P49006 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MARCKSL1P49006 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MARCKSL1P49006 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MARCKSL1P49006 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MARCKSL1P49006 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MARCKSL1P49006 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MARCKSL1P49006 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MARCKSL1P49006 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MARCKSL1P49006 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MARCKSL1P49006 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MARCKSL1P49006 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MARCKSL1P49006 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MARCKSL1P49006 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MARCKSL1P49006 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MARCKSL1P49006 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MARCKSL1P49006 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MARCKSL1P49006 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms