Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC1A1P43005 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC1A1P43005 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC1A1P43005 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC1A1P43005 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC1A1P43005 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC1A1P43005 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC1A1P43005 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC1A1P43005 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC1A1P43005 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC1A1P43005 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC1A1P43005 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC1A1P43005 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC1A1P43005 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC1A1P43005 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC1A1P43005 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC1A1P43005 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC1A1P43005 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC1A1P43005 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC1A1P43005 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC1A1P43005 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC1A1P43005 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC1A1P43005 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC1A1P43005 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC1A1P43005 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC1A1P43005 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC1A1P43005 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC1A1P43005 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC1A1P43005 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC1A1P43005 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC1A1P43005 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC1A1P43005 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC1A1P43005 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC1A1P43005 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC1A1P43005 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC1A1P43005 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC1A1P43005 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC1A1P43005 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC1A1P43005 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC1A1P43005 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC1A1P43005 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC1A1P43005 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC1A1P43005 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC1A1P43005 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC1A1P43005 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC1A1P43005 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC1A1P43005 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC1A1P43005 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC1A1P43005 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC1A1P43005 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SLC1A1P43005 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC1A1P43005 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC1A1P43005 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC1A1P43005 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC1A1P43005 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC1A1P43005 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC1A1P43005 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC1A1P43005 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC1A1P43005 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC1A1P43005 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC1A1P43005 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC1A1P43005 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC1A1P43005 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC1A1P43005 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC1A1P43005 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC1A1P43005 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC1A1P43005 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC1A1P43005 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC1A1P43005 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC1A1P43005 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC1A1P43005 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC1A1P43005 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC1A1P43005 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC1A1P43005 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC1A1P43005 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC1A1P43005 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC1A1P43005 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC1A1P43005 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC1A1P43005 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC1A1P43005 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC1A1P43005 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC1A1P43005 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC1A1P43005 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC1A1P43005 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC1A1P43005 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC1A1P43005 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC1A1P43005 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC1A1P43005 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC1A1P43005 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC1A1P43005 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC1A1P43005 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC1A1P43005 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC1A1P43005 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC1A1P43005 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC1A1P43005 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC1A1P43005 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC1A1P43005 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC1A1P43005 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC1A1P43005 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC1A1P43005 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.1 ms