Protein–RNA interactions for Protein: P31321

PRKAR1B, cAMP-dependent protein kinase type I-beta regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1BP31321 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAR1BP31321 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAR1BP31321 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAR1BP31321 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAR1BP31321 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAR1BP31321 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAR1BP31321 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAR1BP31321 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAR1BP31321 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAR1BP31321 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAR1BP31321 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAR1BP31321 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAR1BP31321 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAR1BP31321 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAR1BP31321 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAR1BP31321 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAR1BP31321 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAR1BP31321 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAR1BP31321 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAR1BP31321 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAR1BP31321 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAR1BP31321 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAR1BP31321 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAR1BP31321 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAR1BP31321 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAR1BP31321 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAR1BP31321 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAR1BP31321 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKAR1BP31321 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKAR1BP31321 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKAR1BP31321 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKAR1BP31321 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKAR1BP31321 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKAR1BP31321 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKAR1BP31321 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKAR1BP31321 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKAR1BP31321 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKAR1BP31321 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKAR1BP31321 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKAR1BP31321 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKAR1BP31321 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKAR1BP31321 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAR1BP31321 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAR1BP31321 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAR1BP31321 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAR1BP31321 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAR1BP31321 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAR1BP31321 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAR1BP31321 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAR1BP31321 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAR1BP31321 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAR1BP31321 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAR1BP31321 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAR1BP31321 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAR1BP31321 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKAR1BP31321 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKAR1BP31321 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKAR1BP31321 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKAR1BP31321 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKAR1BP31321 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKAR1BP31321 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKAR1BP31321 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAR1BP31321 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAR1BP31321 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms