Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DMAP28067 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DMAP28067 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DMAP28067 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-DMAP28067 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-DMAP28067 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-DMAP28067 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-DMAP28067 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-DMAP28067 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DMAP28067 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DMAP28067 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DMAP28067 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-DMAP28067 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-DMAP28067 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DMAP28067 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DMAP28067 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DMAP28067 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DMAP28067 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-DMAP28067 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-DMAP28067 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-DMAP28067 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-DMAP28067 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-DMAP28067 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DMAP28067 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DMAP28067 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DMAP28067 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DMAP28067 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DMAP28067 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DMAP28067 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DMAP28067 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DMAP28067 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DMAP28067 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-DMAP28067 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-DMAP28067 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-DMAP28067 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-DMAP28067 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-DMAP28067 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-DMAP28067 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DMAP28067 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DMAP28067 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DMAP28067 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DMAP28067 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HLA-DMAP28067 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HLA-DMAP28067 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-DMAP28067 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-DMAP28067 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-DMAP28067 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-DMAP28067 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-DMAP28067 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DMAP28067 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DMAP28067 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DMAP28067 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DMAP28067 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DMAP28067 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DMAP28067 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DMAP28067 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DMAP28067 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-DMAP28067 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-DMAP28067 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-DMAP28067 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-DMAP28067 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DMAP28067 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DMAP28067 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DMAP28067 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DMAP28067 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HLA-DMAP28067 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HLA-DMAP28067 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms