Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C6orf47O95873 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C6orf47O95873 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C6orf47O95873 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C6orf47O95873 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C6orf47O95873 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C6orf47O95873 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C6orf47O95873 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C6orf47O95873 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C6orf47O95873 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C6orf47O95873 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C6orf47O95873 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C6orf47O95873 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C6orf47O95873 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C6orf47O95873 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C6orf47O95873 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
C6orf47O95873 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C6orf47O95873 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C6orf47O95873 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C6orf47O95873 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C6orf47O95873 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C6orf47O95873 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C6orf47O95873 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C6orf47O95873 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C6orf47O95873 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C6orf47O95873 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C6orf47O95873 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C6orf47O95873 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C6orf47O95873 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C6orf47O95873 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C6orf47O95873 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C6orf47O95873 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C6orf47O95873 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C6orf47O95873 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C6orf47O95873 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C6orf47O95873 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C6orf47O95873 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C6orf47O95873 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C6orf47O95873 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C6orf47O95873 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
C6orf47O95873 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C6orf47O95873 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
C6orf47O95873 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
C6orf47O95873 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C6orf47O95873 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C6orf47O95873 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C6orf47O95873 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C6orf47O95873 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C6orf47O95873 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C6orf47O95873 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C6orf47O95873 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C6orf47O95873 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C6orf47O95873 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C6orf47O95873 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C6orf47O95873 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C6orf47O95873 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C6orf47O95873 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C6orf47O95873 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C6orf47O95873 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C6orf47O95873 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C6orf47O95873 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C6orf47O95873 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C6orf47O95873 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C6orf47O95873 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C6orf47O95873 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C6orf47O95873 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C6orf47O95873 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C6orf47O95873 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms