Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF6O94906 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF6O94906 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF6O94906 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPF6O94906 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF6O94906 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF6O94906 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF6O94906 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF6O94906 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF6O94906 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF6O94906 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF6O94906 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF6O94906 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF6O94906 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF6O94906 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF6O94906 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF6O94906 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF6O94906 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF6O94906 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF6O94906 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF6O94906 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF6O94906 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF6O94906 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF6O94906 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF6O94906 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF6O94906 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF6O94906 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF6O94906 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF6O94906 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF6O94906 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF6O94906 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF6O94906 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF6O94906 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF6O94906 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF6O94906 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF6O94906 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF6O94906 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF6O94906 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF6O94906 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF6O94906 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF6O94906 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF6O94906 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF6O94906 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF6O94906 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF6O94906 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF6O94906 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF6O94906 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF6O94906 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF6O94906 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF6O94906 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF6O94906 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF6O94906 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF6O94906 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF6O94906 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF6O94906 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF6O94906 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF6O94906 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF6O94906 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF6O94906 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF6O94906 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF6O94906 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF6O94906 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF6O94906 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF6O94906 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF6O94906 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF6O94906 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF6O94906 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF6O94906 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF6O94906 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF6O94906 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF6O94906 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF6O94906 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF6O94906 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF6O94906 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF6O94906 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF6O94906 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF6O94906 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF6O94906 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF6O94906 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF6O94906 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF6O94906 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF6O94906 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF6O94906 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF6O94906 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF6O94906 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF6O94906 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF6O94906 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF6O94906 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF6O94906 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRPF6O94906 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRPF6O94906 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF6O94906 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF6O94906 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF6O94906 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF6O94906 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF6O94906 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF6O94906 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF6O94906 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF6O94906 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF6O94906 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms