Protein–RNA interactions for Protein: O15127

SCAMP2, Secretory carrier-associated membrane protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP2O15127 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAMP2O15127 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAMP2O15127 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAMP2O15127 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAMP2O15127 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAMP2O15127 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAMP2O15127 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAMP2O15127 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAMP2O15127 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAMP2O15127 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAMP2O15127 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAMP2O15127 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAMP2O15127 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAMP2O15127 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAMP2O15127 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAMP2O15127 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAMP2O15127 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAMP2O15127 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAMP2O15127 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAMP2O15127 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAMP2O15127 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAMP2O15127 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAMP2O15127 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAMP2O15127 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAMP2O15127 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAMP2O15127 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAMP2O15127 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAMP2O15127 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAMP2O15127 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAMP2O15127 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAMP2O15127 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAMP2O15127 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAMP2O15127 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAMP2O15127 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAMP2O15127 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAMP2O15127 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAMP2O15127 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAMP2O15127 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAMP2O15127 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAMP2O15127 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAMP2O15127 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAMP2O15127 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAMP2O15127 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAMP2O15127 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAMP2O15127 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAMP2O15127 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAMP2O15127 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAMP2O15127 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAMP2O15127 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAMP2O15127 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAMP2O15127 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAMP2O15127 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAMP2O15127 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAMP2O15127 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAMP2O15127 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAMP2O15127 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAMP2O15127 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAMP2O15127 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAMP2O15127 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAMP2O15127 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAMP2O15127 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAMP2O15127 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAMP2O15127 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAMP2O15127 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAMP2O15127 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAMP2O15127 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAMP2O15127 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAMP2O15127 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAMP2O15127 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCAMP2O15127 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCAMP2O15127 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAMP2O15127 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAMP2O15127 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAMP2O15127 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAMP2O15127 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAMP2O15127 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAMP2O15127 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAMP2O15127 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAMP2O15127 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAMP2O15127 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAMP2O15127 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAMP2O15127 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAMP2O15127 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAMP2O15127 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAMP2O15127 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAMP2O15127 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAMP2O15127 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAMP2O15127 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAMP2O15127 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAMP2O15127 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAMP2O15127 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAMP2O15127 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAMP2O15127 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAMP2O15127 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAMP2O15127 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAMP2O15127 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAMP2O15127 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAMP2O15127 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCAMP2O15127 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAMP2O15127 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms