Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C4orf47A7E2U8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
C4orf47A7E2U8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C4orf47A7E2U8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
C4orf47A7E2U8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C4orf47A7E2U8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C4orf47A7E2U8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
C4orf47A7E2U8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C4orf47A7E2U8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C4orf47A7E2U8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C4orf47A7E2U8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C4orf47A7E2U8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C4orf47A7E2U8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
C4orf47A7E2U8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
C4orf47A7E2U8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C4orf47A7E2U8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C4orf47A7E2U8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C4orf47A7E2U8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C4orf47A7E2U8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C4orf47A7E2U8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C4orf47A7E2U8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C4orf47A7E2U8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C4orf47A7E2U8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
C4orf47A7E2U8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C4orf47A7E2U8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C4orf47A7E2U8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C4orf47A7E2U8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C4orf47A7E2U8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C4orf47A7E2U8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
C4orf47A7E2U8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C4orf47A7E2U8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C4orf47A7E2U8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C4orf47A7E2U8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4orf47A7E2U8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
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