Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVQ3

LINC00854, Long intergenic non-protein coding RNA 854, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00854A0A1B0GVQ3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00854A0A1B0GVQ3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00854A0A1B0GVQ3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00854A0A1B0GVQ3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00854A0A1B0GVQ3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00854A0A1B0GVQ3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00854A0A1B0GVQ3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00854A0A1B0GVQ3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00854A0A1B0GVQ3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00854A0A1B0GVQ3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00854A0A1B0GVQ3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00854A0A1B0GVQ3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00854A0A1B0GVQ3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00854A0A1B0GVQ3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00854A0A1B0GVQ3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00854A0A1B0GVQ3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00854A0A1B0GVQ3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00854A0A1B0GVQ3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00854A0A1B0GVQ3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00854A0A1B0GVQ3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00854A0A1B0GVQ3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00854A0A1B0GVQ3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00854A0A1B0GVQ3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00854A0A1B0GVQ3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00854A0A1B0GVQ3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00854A0A1B0GVQ3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00854A0A1B0GVQ3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00854A0A1B0GVQ3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00854A0A1B0GVQ3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00854A0A1B0GVQ3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00854A0A1B0GVQ3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00854A0A1B0GVQ3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00854A0A1B0GVQ3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00854A0A1B0GVQ3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00854A0A1B0GVQ3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00854A0A1B0GVQ3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00854A0A1B0GVQ3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00854A0A1B0GVQ3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00854A0A1B0GVQ3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00854A0A1B0GVQ3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00854A0A1B0GVQ3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00854A0A1B0GVQ3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00854A0A1B0GVQ3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00854A0A1B0GVQ3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00854A0A1B0GVQ3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00854A0A1B0GVQ3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00854A0A1B0GVQ3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00854A0A1B0GVQ3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00854A0A1B0GVQ3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00854A0A1B0GVQ3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00854A0A1B0GVQ3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00854A0A1B0GVQ3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00854A0A1B0GVQ3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00854A0A1B0GVQ3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00854A0A1B0GVQ3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00854A0A1B0GVQ3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00854A0A1B0GVQ3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00854A0A1B0GVQ3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC00854A0A1B0GVQ3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC00854A0A1B0GVQ3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC00854A0A1B0GVQ3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00854A0A1B0GVQ3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00854A0A1B0GVQ3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00854A0A1B0GVQ3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00854A0A1B0GVQ3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00854A0A1B0GVQ3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00854A0A1B0GVQ3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00854A0A1B0GVQ3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00854A0A1B0GVQ3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00854A0A1B0GVQ3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00854A0A1B0GVQ3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00854A0A1B0GVQ3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00854A0A1B0GVQ3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00854A0A1B0GVQ3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00854A0A1B0GVQ3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00854A0A1B0GVQ3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00854A0A1B0GVQ3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00854A0A1B0GVQ3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00854A0A1B0GVQ3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00854A0A1B0GVQ3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00854A0A1B0GVQ3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00854A0A1B0GVQ3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00854A0A1B0GVQ3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00854A0A1B0GVQ3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00854A0A1B0GVQ3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00854A0A1B0GVQ3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00854A0A1B0GVQ3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00854A0A1B0GVQ3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00854A0A1B0GVQ3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00854A0A1B0GVQ3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00854A0A1B0GVQ3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00854A0A1B0GVQ3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00854A0A1B0GVQ3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00854A0A1B0GVQ3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00854A0A1B0GVQ3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00854A0A1B0GVQ3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00854A0A1B0GVQ3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00854A0A1B0GVQ3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00854A0A1B0GVQ3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00854A0A1B0GVQ3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms