Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD21O60216 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD21O60216 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD21O60216 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD21O60216 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD21O60216 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD21O60216 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD21O60216 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD21O60216 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD21O60216 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD21O60216 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD21O60216 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD21O60216 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD21O60216 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD21O60216 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD21O60216 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD21O60216 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD21O60216 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD21O60216 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD21O60216 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD21O60216 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD21O60216 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD21O60216 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD21O60216 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD21O60216 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD21O60216 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD21O60216 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD21O60216 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD21O60216 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD21O60216 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD21O60216 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD21O60216 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD21O60216 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD21O60216 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD21O60216 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD21O60216 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD21O60216 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD21O60216 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD21O60216 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD21O60216 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD21O60216 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD21O60216 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD21O60216 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD21O60216 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD21O60216 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD21O60216 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD21O60216 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD21O60216 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD21O60216 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD21O60216 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD21O60216 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD21O60216 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD21O60216 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD21O60216 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD21O60216 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD21O60216 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD21O60216 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD21O60216 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD21O60216 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD21O60216 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD21O60216 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD21O60216 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD21O60216 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD21O60216 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD21O60216 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD21O60216 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD21O60216 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD21O60216 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD21O60216 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD21O60216 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD21O60216 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD21O60216 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD21O60216 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD21O60216 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD21O60216 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD21O60216 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD21O60216 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD21O60216 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD21O60216 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD21O60216 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD21O60216 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD21O60216 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD21O60216 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD21O60216 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD21O60216 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD21O60216 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD21O60216 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD21O60216 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD21O60216 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD21O60216 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD21O60216 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD21O60216 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD21O60216 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD21O60216 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD21O60216 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD21O60216 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD21O60216 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD21O60216 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD21O60216 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD21O60216 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms