Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms