Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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EXT1Q16394 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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EXT1Q16394 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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EXT1Q16394 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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EXT1Q16394 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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EXT1Q16394 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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EXT1Q16394 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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