Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms