Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3KRW8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3KRW8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
J3KRW8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3KRW8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3KRW8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3KRW8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3KRW8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3KRW8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3KRW8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3KRW8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3KRW8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3KRW8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3KRW8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3KRW8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3KRW8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3KRW8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3KRW8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3KRW8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3KRW8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3KRW8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3KRW8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3KRW8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3KRW8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3KRW8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3KRW8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3KRW8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3KRW8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3KRW8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3KRW8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3KRW8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3KRW8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3KRW8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3KRW8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
J3KRW8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3KRW8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3KRW8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3KRW8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3KRW8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3KRW8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3KRW8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3KRW8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3KRW8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3KRW8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3KRW8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3KRW8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
J3KRW8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
J3KRW8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
J3KRW8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
J3KRW8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
J3KRW8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
J3KRW8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
J3KRW8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
J3KRW8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
J3KRW8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
J3KRW8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
J3KRW8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
J3KRW8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
J3KRW8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
J3KRW8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
J3KRW8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms