Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms