Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2E1P29083 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms